超市直接对内盗员工罚款5000元的行为，在法律上通常是不合理的，且可能涉嫌违法。以下从多个角度进行分析：

1. 罚款权限的法定性
   根据《劳动合同法》及相关规定，用人单位无权自行设定罚款制度。罚款属于行政处罚范畴，只有法律授权的行政机关（如公安机关、市场监管部门）才有权实施。超市作为经营主体，无权以“内部规定”为由对员工进行罚款，即使员工存在盗窃行为，超市也应通过报警、解除劳动合同等合法途径处理，而非直接罚款。

2. 罚款金额的合理性
   即使假设超市有罚款权（实际无），罚款金额也需符合“过错与处罚相当”原则。根据《工资支付暂行规定》，因员工过错造成损失的，用人单位可要求赔偿，但每月扣除部分不得超过当月工资的20%，且扣除后工资不得低于当地最低工资标准。若员工月薪不足25000元（5000元÷20%），罚款5000元显然超出法定限额，属于违法扣减工资。

3. 合法处理途径
   超市发现员工盗窃后，应采取以下合法措施：

   • 报警处理：盗窃行为涉嫌违法，超市可向公安机关报案，由司法机关追究员工刑事责任或行政责任；
     
   • 解除劳动合同：根据《劳动合同法》第三十九条，员工严重违反用人单位规章制度或被依法追究刑事责任的，超市可单方解除合同，且无需支付经济补偿；
     
   • 要求赔偿损失：若盗窃行为造成实际损失（如商品价值），超市可要求员工赔偿，但需通过劳动仲裁或诉讼程序，而非直接罚款。

4. 员工维权建议
   若超市已罚款，员工可：

   • 与超市协商：要求退还违法罚款，并保留工资条、罚款通知等证据；
     
   • 向劳动监察部门投诉：举报超市违法扣减工资的行为；
     
   • 申请劳动仲裁：主张超市支付被扣工资，并可能获得赔偿金。

总结：超市直接罚款5000元的行为缺乏法律依据，员工有权拒绝并维权。若您遇到类似情况，可直接向我咨询具体应对方案，我会结合您的具体情况提供详细法律指导。