工厂不干了，牌照不是老板的情况下，责任归属问题需要分情况讨论：
如果工厂是合法经营，且牌照是依法取得并登记在工厂名下（非老板个人名下）：
- 在这种情况下，工厂作为独立的法律主体，应当对其经营行为负责。如果工厂因为经营不善或其他原因停止运营，其债务和责任一般应由工厂的资产来承担，而不是直接由老板个人承担。
- 但是，如果老板作为工厂的法定代表人或主要负责人，在经营过程中存在违法行为（如欺诈、偷税漏税等），或者存在个人财产与工厂财产混同的情况，那么老板可能需要承担相应的法律责任。
如果工厂的牌照是非法取得，或者存在其他违法行为：
- 在这种情况下，无论牌照是否登记在老板名下，工厂和老板都可能面临法律责任。特别是如果老板是非法行为的直接参与者或组织者，那么老板可能需要承担更严重的法律责任。
- 此外，如果工厂因为非法行为被吊销牌照或关闭，老板还可能面临行政处罚或刑事责任。
关于工厂停止运营后的员工权益问题：
- 无论工厂的牌照是否登记在老板名下，工厂停止运营都不应影响员工的合法权益。员工有权要求工厂支付拖欠的工资、经济补偿金等。
- 如果工厂无法支付这些费用，员工可以向劳动监察部门投诉，或者通过法律途径（如申请劳动仲裁、提起诉讼）来维护自己的权益。
法律建议：
- 对于工厂而言，应当依法经营，确保牌照的合法性和有效性。如果工厂因为各种原因需要停止运营，应当妥善处理员工的权益问题，避免引发法律纠纷。
- 对于老板而言，应当明确自己的法律责任和义务，避免将个人财产与工厂财产混同。如果工厂存在违法行为或面临法律纠纷，老板应当积极配合相关部门进行调查和处理。
- 对于员工而言，如果工厂停止运营且拖欠工资等费用，应当及时向劳动监察部门投诉或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
可能涉及的法律后果：
- 如果工厂或老板存在违法行为，可能面临行政处罚（如罚款、吊销执照等）或刑事责任（如有期徒刑、罚金等）。
- 如果员工权益受到侵害且未得到妥善处理，员工可以通过法律途径追究工厂或老板的责任，并要求赔偿相应的损失。
如果您有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供详细的法律建议。