非法占用农用地，即使土地性质后来变更为工业用地，也仍然可能面临追诉。具体分析如下：

1. 非法占用农用地罪的构成：

   • 非法占用农用地罪是指违反土地管理法规，非法占用耕地、林地等农用地，改变被占用土地用途，数量较大，造成农用地大量毁坏的行为。
   • 此罪侵犯的客体是国家的土地管理制度，特别是耕地、林地等农用地的保护制度。
   • 主体既可以是自然人，也可以是单位。
   • 在主观方面表现为故意，即明知占用农用地会改变土地用途，且可能造成农用地大量毁坏，仍实施该行为。

2. 土地性质变更的影响：

   • 土地性质的变更（如从农用地变更为工业用地）并不改变非法占用农用地这一行为的性质。
   • 如果非法占用行为发生在土地性质变更之前，且该行为已经构成犯罪，那么即使后来土地性质发生了变更，也不能免除行为人的刑事责任。

3. 追诉期的规定：

   • 非法占用农用地存在追诉期，追诉期的长短取决于法定最高刑的年限。
   • 根据《刑法》的规定，若法定最高刑是五年以下有期徒刑或拘役，追诉时效就是五年；以此类推，法定最高刑为五年以上十年以下有期徒刑的，追诉时效为十年；法定最高刑为十年以上有期徒刑的，追诉时效为十五年；法定最高刑是无期徒刑或死刑的，追诉时效为二十年。
   • 在追诉期限内又犯罪的，前罪的追诉期限从犯后罪之日开始计算。

4. 结论：

   • 因此，即使非法占用的农用地后来变更为工业用地，如果非法占用行为已经构成犯罪，并且在追诉期内被发现，司法机关仍然可以追究行为人的刑事责任。
   • 如果您面临此类问题，建议尽快咨询专业律师，以便了解具体的法律风险和应对策略。作为专业律师，我可以为您提供详细的法律咨询和帮助。