基本建设项目违法占地罚款列入项目成本，这一行为主要违反了以下规定：

1. 违反了财务管理和会计核算的相关规定：

   • 根据《企业财务通则》和《企业会计准则》等相关规定，企业的财务支出应当遵循合法、合规的原则，不得将违法违规的支出列入成本。违法占地罚款属于因企业违法行为而产生的支出，不应列入项目成本，否则将导致企业财务数据的失真，影响财务报告的真实性和准确性。

2. 违反了土地管理和城乡规划的相关法律法规：

   • 违法占地行为本身就违反了《土地管理法》、《城乡规划法》等相关法律法规。这些法律法规明确规定了土地使用的合法性和规划性要求，对于违法占地行为，相关部门有权进行处罚，包括罚款等措施。将违法占地罚款列入项目成本，实际上是在为违法行为“买单”，这不仅违反了法律法规的规定，也助长了违法占地行为的发生。

3. 可能涉及税务违规：

   • 在税务处理上，违法占地罚款通常不被视为可税前扣除的费用。根据《企业所得税法》等相关规定，企业发生的与取得收入无关的支出，不得在计算应纳税所得额时扣除。违法占地罚款与企业的正常生产经营活动无直接关联，因此不应列入项目成本进行税前扣除。如果企业将违法占地罚款列入项目成本并进行了税前扣除，将可能面临税务部门的处罚。

综上所述，基本建设项目违法占地罚款列入项目成本的行为，违反了财务管理和会计核算的相关规定、土地管理和城乡规划的相关法律法规，以及可能涉及税务违规。企业应当严格遵守相关法律法规和财务管理规定，确保财务支出的合法性和合规性。如有任何法律问题或疑问，可以直接向我咨询。