对于同时存在违法占地和违法建设的情况，相关部门将依据《中华人民共和国土地管理法》、《中华人民共和国城乡规划法》等相关法律法规，综合考虑两种违法行为的情节和后果，依法分别作出处罚决定，并合并执行。以下是对此问题的详细分析：
一、违法占地的处罚
责令退还土地：
- 违法占用土地的单位或个人需将非法占用的土地返还给原土地所有者或使用者。例如，若企业未经批准占用了农村集体土地建厂，则需将土地退还给村集体。
限期拆除与没收：
- 对于违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，相关部门会限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，并恢复土地原状。
- 若非法占用但符合土地利用总体规划，则可能没收这些建筑物和设施。
罚款：
- 对非法占用土地的行为，可并处每平方米100元以上1000元以下的罚款，具体金额根据违法情节确定。例如，非法占用耕地以外的其他农用地，罚款标准可能相对较低；而非法占用永久基本农田，则罚款标准会更高。
行政处分与刑事责任：
- 涉及国家工作人员的违法占地行为，将依法给予警告、记过、记大过、降级、撤职、开除等行政处分。
- 若占用耕地数量较大，造成耕地大量毁坏，将依照《中华人民共和国刑法》相关规定，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处或者单处罚金。
二、违法建设的处罚
责令停止建设：
- 一旦发现违法建设行为，相关部门会立即责令建设单位或个人停止施工，以防止违法建设进一步扩大。
限期改正并处罚款：
- 对于尚可采取改正措施消除对规划实施影响的，限期改正，并处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款。
限期拆除与没收：
- 无法采取改正措施消除影响的，限期拆除；不能拆除的，没收实物或者违法收入，并可并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
查封与强制拆除：
- 若当事人不停止建设或逾期不拆除，县级以上地方人民政府可责成有关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。
三、综合处理原则与建议
分别处罚与合并执行：
- 相关部门将依据不同法律法规，对违法占地和违法建设行为分别进行处罚，并综合考虑两种违法行为的情节和后果，确保处罚决定的合并执行。
因地制宜与具体分析：
- 具体的处罚措施和力度会根据不同地区的实际情况和政策有所差异。因此，在处理此类问题时，需结合当地的具体规定和实际情况进行具体分析。
主动纠正与配合调查：
- 对于已发生的违法行为，建议违法者积极配合政府部门的调查处理，主动采取措施纠正错误，以减轻可能的法律责任。
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