针对同一违法建筑既违反《城乡规划法》又违反《土地管理法》的处理，核心结论在于：行政机关不得对同一违法行为给予两次以上罚款的行政处罚，但可依据不同法律条款采取其他非罚款的处罚措施。 以下从不同角度进行详细分析：

一、法律原则：一事不再罚

根据《中华人民共和国行政处罚法》第二十四条的规定：“对当事人的同一个违法行为，不得给予两次以上罚款的行政处罚。” 这一原则被称为“一事不再罚”原则，其目的在于防止行政机关对同一违法行为进行重复处罚，保护当事人的合法权益。在违法建筑的处理中，如果行政机关已经依据《土地管理法》对违法建筑进行了罚款处罚，那么就不能再依据《城乡规划法》对同一违法建筑进行罚款处罚。

二、违法建筑的认定与处理

1. 违法建筑的认定：

   • 违法建筑是指违反了《土地管理法》、《城乡规划法》等相关法律法规的规定而建造的建筑物。
   • 具体可以分为两类：一是违反《土地管理法》，未取得建设用地使用权而建造的建筑物；二是违反《城乡规划法》，未获得规划许可或者违反规划许可，擅自在自己享有建设用地使用权的土地上建造的建筑物。

2. 违法建筑的处理：

   • 对于违法建筑，行政机关可以依据《土地管理法》和《城乡规划法》的相关规定，采取责令退还非法占用的土地、限期拆除、没收建筑物和其他设施、并处罚款等处罚措施。
   • 但需要注意的是，如果行政机关已经依据某一法律条款对违法建筑进行了罚款处罚，那么就不能再依据另一法律条款对同一违法建筑进行罚款处罚。不过，行政机关可以依据其他法律条款采取其他非罚款的处罚措施，如责令退还土地、限期拆除等。

三、实际案例分析

以山东省东营市中级人民法院的复议案件为例，东营市甲子化工有限公司在河口区孤岛镇工业园区违法建设多处房屋，既违反了《土地管理法》又违反了《城乡规划法》。东营市国土资源局已经依据《土地管理法》对该行为作出了罚款处罚，河口执法局则不能再以该行为违反《城乡规划法》为由进行罚款处罚。最终，法院裁定对河口执法局的处罚决定不准予强制执行。

四、法律建议

1. 对于行政机关：

   • 在处理违法建筑时，应严格遵守“一事不再罚”原则，避免对同一违法行为进行重复处罚。
   • 应依据违法建筑的实际情况和法律法规的规定，合理选择处罚措施，确保处罚的合法性和有效性。

2. 对于当事人：

   • 如果认为行政机关的处罚决定存在违法或不当之处，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
   • 在建设建筑物时，应严格遵守相关法律法规的规定，取得必要的建设用地使用权和规划许可，避免违法建筑的产生。

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