对于既有土地违法又有规划违法的情况，处理时应综合考虑两部法律的立法目的、处罚分工以及违法行为的性质，一般应由土地主管部门先行处理土地违法行为。以下是详细的分析：

一. 立法目的与处罚分工

1. 土地管理法：主要目的是“保护、开发土地资源，合理利用土地，切实保护耕地”，针对的是违法占地行为，如“未经批准或者采取欺骗手段骗取批准非法占地”、“擅自将农用地改为建设用地”、“占用耕地进行建设以及破坏种植条件的其他行为”等。

2. 城乡规划法：主要目的是“协调城乡空间布局，改善人居环境，促进城乡经济社会全面协调可持续发展”，针对的是“未取得规划许可证或者未按照规划许可证进行建设”的违法行为。

   • 例如，若某建设单位在未经批准的土地上擅自建设，同时违反了土地管理法和城乡规划法，但因其首先违反了土地管理法的相关规定，即违法占地，因此应由土地主管部门先行处理。

二. 处理原则

1. 优先处理土地违法：对于既有土地违法又有规划违法的案件，一般应由土地主管部门按照土地管理法的相关规定先行处理土地违法行为。待土地违法行为得到纠正后，再根据城乡规划法的相关规定处理规划违法行为。

2. 综合考虑处罚：在处理过程中，应综合考虑两部法律的立法目的、处罚分工以及违法行为的性质、情节等因素，确保处罚的公正性和合理性。

三. 具体处理措施

1. 责令改正：对于情节轻微的违法行为，相关部门可责令违法用地者在规定期限内自行改正违法行为，如拆除违法建筑物、恢复土地原状等。

2. 行政处罚：根据违法行为的性质和情节，可对违法者进行罚款、没收违法所得等行政处罚。

3. 补办手续：对于符合土地利用总体规划和相关建设规划，仅在用地手续上存在欠缺的项目，可在缴纳相关费用、履行规定程序后，为其补办用地审批手续。

4. 追究刑事责任：如果违法行为构成犯罪，如非法占用农用地罪，将依法追究刑事责任。

我建议，在处理既有土地违法又有规划违法的案件时，应充分理解并遵循土地管理法和城乡规划法的立法目的和处罚分工，确保处理措施的合法性和有效性。同时，也应加强土地法规和规划法规的宣传和教育，提高公众的土地规划和利用意识。如有进一步需要，您可以继续咨询我。