对于一座房子同时违反国土法和规划法的情形，通常需要接受双重处罚，并需通过整改或拆除等措施消除违法状态。具体分析如下：
法律责任的叠加性
根据《土地管理法》和《城乡规划法》的立法逻辑，两部法律分别从土地用途管制和空间布局管控角度规范建设行为。若同一房屋既存在非法占用土地（如占用农用地、超占面积等），又存在未取得建设工程规划许可证或违反规划条件建设（如层高超限、建筑退界不足等），则构成双重违法状态，行政机关可依据两部法律分别作出处罚决定。
处罚程序的衔接规则
实践中，自然资源部门（原国土部门）和城乡规划部门可能通过联合执法或信息共享机制同步发现违法行为。根据《行政处罚法》第29条”一事不再罚”原则的例外情形，对同一违法行为违反多个法律规范的，若不同法律规范规定的处罚种类不同（如国土法规定”责令退还土地+罚款”，规划法规定”限期拆除+没收违法收入”），行政机关可分别实施处罚，但需注意：
- 处罚主体需具有法定职权（如自然资源部门负责土地违法，规划部门负责规划违法）
- 处罚决定需明确违法事实与法律依据的对应关系
- 避免对同一违法后果重复评价（如不得对同一建筑面积既按国土法罚款又按规划法没收）
整改措施的复合要求
在责令改正阶段，当事人需同时满足：
- 土地违法整改：退还非法占用土地、恢复土地原状、缴纳土地复垦费等
- 规划违法整改：补办规划许可（若符合规划条件）、限期拆除（若严重影响规划）、缴纳罚款等
若房屋已建成且无法通过补办手续合法化，则可能面临强制拆除，拆除费用由违法建设人承担。
特殊情形的处理原则
- 历史遗留问题：对2008年《城乡规划法》实施前建成的房屋，部分地区允许通过补缴土地出让金、完善规划手续等方式”转正”，但需符合当地政策
- 民生保障考量：对唯一住房等特殊情形，行政机关可能采取”先处罚后补证”或”暂缓拆除”等柔性执法措施
- 刑事责任风险：若违法占用基本农田达5亩以上或占用其他农用地达10亩以上，可能触犯《刑法》第342条非法占用农用地罪
建议处理步骤：
- 立即委托专业机构对房屋进行合规性鉴定（包括土地性质、规划指标等）
- 向自然资源部门和规划部门申请信息公开，明确具体违法事项及处罚依据
- 制定整改方案时需同步考虑土地复垦和规划调整的可行性
- 在行政处罚决定作出前可申请听证，对违法事实认定、法律适用等提出异议
如需进一步分析具体案情中的法律适用问题，可直接向我提供房屋建设时间、土地性质、规划审批情况等关键信息。