对于同时存在非法占地和违法建设的情况，相关部门会依据相关法律法规，对两种违法行为分别进行处罚，并合并执行。以下是对这一问题的详细分析：

一、非法占地的处罚

非法占地行为主要违反了《中华人民共和国土地管理法》等相关法律法规。对于此类行为，相关部门会采取以下处罚措施：

1. 责令退还土地：要求违法占用土地的单位或个人将非法占用的土地返还给原土地所有者或使用者。例如，若某企业未经批准占用了农村集体土地建厂，那么相关部门会要求该企业将土地退还给村集体。
2. 罚款：对非法占用土地的行为，可并处每平方米100元以上1000元以下的罚款。具体罚款金额会根据违法占地的性质、面积以及情节严重程度等因素确定。
3. 限期拆除与没收：对于违反土地利用总体规划擅自将农用地改为建设用地的，限期拆除在非法占用的土地上新建的建筑物和其他设施，恢复土地原状；若符合土地利用总体规划，则可能没收这些建筑物和设施。
4. 刑事责任：若非法占地行为达到严重程度，如占用耕地数量较大并造成耕地大量毁坏，那么根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，可能构成非法占用农用地罪，将受到刑事处罚。

二、违法建设的处罚

违法建设行为主要违反了《中华人民共和国城乡规划法》、《中华人民共和国建筑法》等相关法律法规。对于此类行为，相关部门会采取以下处罚措施：

1. 责令停止建设：一旦发现违法建设行为，相关部门会立即责令建设单位或个人停止施工，以防止违法建设进一步扩大。
2. 限期改正并处罚款：对于尚可采取改正措施消除对规划实施影响的违法建设行为，相关部门会责令限期改正，并处建设工程造价百分之五以上百分之十以下的罚款。
3. 限期拆除与没收：对于无法采取改正措施消除影响的违法建设行为，相关部门会责令限期拆除；若不能拆除，则会没收实物或者违法收入，并可能并处建设工程造价百分之十以下的罚款。
4. 查封与强制拆除：若当事人不停止建设或逾期不拆除违法建筑，县级以上地方人民政府可责成有关部门采取查封施工现场、强制拆除等措施。

三、综合处理原则

在实际执法中，对于同时存在非法占地和违法建设的行为，相关部门会遵循以下原则：

• 分别处罚：依据不同法律法规，对非法占地和违法建设行为分别进行处罚。
• 合并执行：综合考虑两种违法行为的情节和后果，确保处罚决定的合并执行，以全面纠正违法行为。
• 因地制宜：具体的处罚措施和力度会根据不同地区的实际情况和政策有所差异。

建议：在进行土地使用和建筑建设时，务必遵守相关法律法规，确保行为合法合规。若存在非法占地或违法建设行为，应尽快采取措施进行整改，以避免受到更严重的法律处罚。如果有任何法律疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。