针对您提出的“非法建房强占民用耕地谁来管理”的问题，这是一个涉及土地管理和法律责任的严肃议题。以下是我为您提供的详细解答：
一、主要监管部门及职责
自然资源部门（原国土资源部门）：
- 核心职责：根据《土地管理法》及相关法规，自然资源部门是非法占用耕地行为的主要监管部门。他们负责调查处理未经批准或采取欺骗手段占用耕地的行为。
- 执法手段：一旦发现非法占用耕地，自然资源部门有权责令退还土地、限期拆除建筑物并恢复耕种，同时可以处以罚款。若行为构成犯罪，还将移送司法机关追究刑事责任。
农业农村部门：
- 协同职责：农业农村部门在涉及破坏永久基本农田耕作层等农业相关问题时，会与自然资源部门联合执法，共同保护耕地资源。
其他相关部门：
- 林业部门：如果非法占用的是林地，那么林业部门将负责查处未批先占的行为。
- 乡镇政府：乡镇政府在发现非法占用耕地行为时，有义务协助制止并及时上报县级主管部门。
二、法律依据与处罚标准
- 法律条款：非法占用农用地违反了《土地管理法》和《刑法》的相关规定。特别是《刑法》第三百四十二条明确禁止非法占用农用地，情节严重的将处五年以下有期徒刑或拘役，并处罚金。
- 处罚梯度：根据违法行为的严重程度，处罚包括责令改正、罚款、没收违法所得、强制拆除建筑物等。若行为构成犯罪，将依法追究刑事责任。
三、维权途径与建议
向自然资源部门举报：
- 您可以通过拨打12336热线或直接到当地国土所反映问题。自然资源部门将依法进行调查处理。
申请行政复议或诉讼：
- 如果您对政府部门的处理结果不满，可以依法申请行政复议或提起行政诉讼，维护自己的合法权益。
保留证据：
- 在发现非法占用耕地行为时，建议您拍摄现场照片、收集书面材料等证据，为后续维权提供支持。
四、社会共治与农民自我保护
- 增强自我保护意识：农民应增强对土地资源的保护意识，及时发现并制止非法占用行为。
- 鼓励公众参与监督：社会各界应加强对土地资源保护的关注和支持，共同推动土地资源的合理利用和可持续发展。
- 建立举报机制：政府应设立便捷的举报渠道，如电话、邮箱等，鼓励公众参与监督非法占用耕地行为。
综上所述，非法建房强占民用耕地的问题主要由自然资源部门负责监管，农业农村、林业等部门在各自职责范围内协同配合。政府相关部门、社会公众及农民自身应共同努力，通过加强法律监管、提升公众意识、完善举报机制等措施，共同维护农民耕地的合法权益和土地资源的合理利用。