可以。公民有权通过遗嘱处分个人身后事务，包括是否与配偶合葬，法律对此不设限制。以下从法律、实务操作、注意事项三个角度展开说明：

一、法律层面：遗嘱自由原则的体现

根据《民法典》第1133条，自然人可立遗嘱处分个人财产，并指定遗嘱执行人；同时，法律未禁止公民通过遗嘱对身后非财产性事务（如葬礼安排、合葬意愿等）作出安排。因此，立遗嘱人明确表示“不与配偶合葬”的意愿，属于遗嘱自由范畴，具有法律效力。

二、实务操作：需满足形式与实质要件

1. 形式要件：遗嘱需符合法定形式（如自书遗嘱需立遗嘱人亲笔书写、签名并注明年月日；代书遗嘱需两名无利害关系见证人等），否则可能被认定无效。
2. 实质要件：立遗嘱人需具有完全民事行为能力，遗嘱内容系其真实意思表示，且不违反法律强制性规定或公序良俗。例如，若遗嘱中要求“将配偶遗体移出家族墓地”等可能侵害他人权益的条款，可能因违反公序良俗被部分或全部无效。

三、注意事项：避免争议的实务建议

1. 明确表达意愿：遗嘱中需清晰写明“不与配偶合葬”的具体安排（如单独安葬地点、方式等），避免因表述模糊引发执行争议。
2. 告知相关方：建议将遗嘱内容告知配偶或子女，减少身后纠纷；若涉及家族墓地管理方，可提前沟通并留存书面确认文件。
3. 结合其他法律文件：若遗嘱中涉及葬礼安排等非财产事务，可同步通过“生前预嘱”“意定监护协议”等文件进一步明确，增强可操作性。

总结：法律尊重公民对身后事务的自主安排，您可通过合法有效的遗嘱明确“不与配偶合葬”的意愿。若需进一步设计遗嘱条款或处理相关纠纷，可直接向我咨询。