以物抵债且双方有约定时，旧债一般因清偿而消灭。以下是对此问题的详细分析：

一. 以物抵债的法律性质

1. 定义与性质：以物抵债，是指当事人之间对于如何清偿债务作出的安排，即债权人同意债务人以他种给付代替其所负担的给付，从而使债的关系消灭。其实质为代物清偿，属于实践性法律行为，需要实际交付标的物或完成其他现实给付才能使原债务消灭。

二. 有约定时旧债的消灭

1. 约定效力：如果双方当事人以书面形式明确约定了以物抵债，并且该约定不违反法律、行政法规的强制性规定，那么该约定是有效的。
2. 旧债消灭：在按照约定完成以物抵债后，即债务人交付了约定的标的物或完成了其他现实给付，原债务（旧债）因清偿而消灭。此时，债权人不得再就原债务向债务人主张权利。

三. 特殊情况的考量

1. 未实际交付或完成给付：如果虽然双方有以物抵债的约定，但债务人并未实际交付标的物或完成其他现实给付，那么原债务并未消灭。债权人仍有权要求债务人按照原约定履行债务。
2. 约定不明确或存在争议：如果双方对于以物抵债的约定不明确或存在争议，那么需要依据相关法律法规和司法解释进行裁判。在这种情况下，可能需要通过诉讼或仲裁等方式来解决争议。

我建议：在以物抵债的过程中，双方当事人应当明确约定相关事项，并确保实际交付标的物或完成其他现实给付，以避免产生不必要的争议。如有进一步需要，您可以继续咨询我。