设计合同终止后，已支付但未开具发票的费用，仍应由收款方开具发票。以下是详细分析：

1. 合同终止与发票开具的独立性
   设计合同的终止仅意味着双方权利义务的终止，但已完成的合同部分（如已提供的设计服务或已交付的成果）仍需按照税法规定处理。根据《中华人民共和国发票管理办法》第十九条，销售商品、提供服务以及从事其他经营活动的单位和个人，对外发生经营业务收取款项，收款方应当向付款方开具发票。因此，即使合同终止，收款方仍有义务就已收取的款项开具发票。

2. 未开具发票的法律后果
   若收款方未开具发票，付款方有权要求其开具。根据《中华人民共和国税收征收管理法》第二十一条，单位、个人在购销商品、提供或者接受经营服务以及从事其他经营活动中，应当按照规定开具、使用、取得发票。若收款方拒不开具，付款方可向税务机关举报，税务机关将责令其限期改正，并可能处以罚款。

3. 实务操作建议

   • 付款方：应保留合同终止协议、付款凭证等证据，以证明款项性质及金额。若收款方拒开发票，可先通过书面函件催告，仍无果的可向税务机关投诉。
     
   • 收款方：若因合同终止导致服务未完全履行，可与付款方协商按实际完成量开具发票，避免因拒开发票引发税务风险。

4. 特殊情形处理
   若合同终止时双方约定“费用不退且不开发票”，该约定可能因违反税法强制性规定而无效。税务机关仍会要求收款方补开发票，且付款方有权主张权益。

总结：设计合同终止不影响发票开具义务，双方应依法处理已发生业务的税务问题。如有具体纠纷，可进一步提供合同条款及终止细节，我将为您分析风险点及应对策略。