关于两年固定期限合同中星期六、星期天是否休息的问题，结论并非绝对，需结合合同具体条款、公司规章制度及法律法规综合判断。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合同约定优先

• 核心依据：根据《劳动合同法》第十七条，劳动合同应当明确约定工作时间和休息休假条款。若您与用人单位签订的两年固定期限合同中明确约定“每周工作五天，周六、周日休息”，则用人单位应遵守此约定。
• 例外情形：若合同未明确约定休息日，或约定“按公司规章制度执行”，则需进一步审查公司制度。

2. 公司规章制度的影响

• 合法性审查：根据《劳动合同法》第四条，用人单位制定的规章制度需经民主程序（如职工代表大会讨论）并公示，否则对劳动者不产生约束力。若公司规章制度规定周六、周日为工作日，但未履行上述程序，您有权拒绝。
• 内容合法性：即使制度合法，每周工作时间也不得超过40小时（标准工时制），且每月加班不得超过36小时。若公司要求周六、周日上班但未安排补休或支付加班费，可能涉嫌违法。

3. 法律法规的底线要求

• 标准工时制：根据《劳动法》第三十六条，劳动者每日工作时间不超过8小时，平均每周不超过44小时。第三十八条明确规定，用人单位应保证劳动者每周至少休息1日。因此，即使合同未明确约定，用人单位也需至少安排每周1天休息，周六、周日是否休息需结合排班安排。
• 综合计算工时制：若公司经劳动行政部门批准实行综合计算工时制，可能通过集中工作、集中休息的方式安排工作时间，但需确保平均周工作时间不超过法定标准。
• 不定时工时制：适用于高管、外勤等岗位，但需劳动行政部门批准，且用人单位仍需保障劳动者休息权。

4. 加班与休息的平衡

• 加班费支付：若周六、周日为工作日且无法安排补休，用人单位需按《劳动法》第四十四条支付200%的工资作为加班费。
• 补休安排：根据《劳动法》第四十四条，休息日安排劳动者工作又不能安排补休的，支付不低于工资的200%的工资报酬。因此，用人单位可选择支付加班费或安排补休。

5. 实务建议

• 审查合同与制度：首先查看劳动合同中关于工作时间的条款，再核实公司规章制度是否合法有效。
• 保留证据：若公司要求周六、周日上班但未支付加班费或安排补休，需保留考勤记录、工资条等证据。
• 协商与投诉：可先与用人单位协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。

总结：周六、周日是否休息需以合同约定为准，但不得违反法律法规的底线要求。若合同未明确或公司制度违法，您有权主张休息权或要求加班费。如有具体争议，建议携带合同及相关证据进一步咨询，我将为您详细分析。