公司因经营困难无法发放工资，员工提出离职时，一般情况下是有经济补偿的，但具体情形需结合实际情况分析。以下从不同角度为您详细阐述：
一、经济补偿的法律依据
根据《劳动合同法》第三十八条和第四十六条的规定，用人单位未及时足额支付劳动报酬的，劳动者可以解除劳动合同，并且用人单位应当向劳动者支付经济补偿。经济补偿的计算标准按照劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
二、公司经营困难与工资发放
公司确实无力支付：
- 如果公司因经营困难确实无力支付工资，且已经向劳动者说明情况，并尽力筹集资金，但仍无法按时支付，这种情况下，劳动者提出离职，公司仍需支付经济补偿。因为公司的经营困难并不构成免除支付经济补偿的法定理由。
公司恶意拖欠：
- 如果公司有能力支付工资但故意拖欠，或者未向劳动者说明情况，导致劳动者被迫提出离职，这种情况下，公司不仅需要支付经济补偿，还可能面临劳动行政部门的处罚，以及劳动者要求支付拖欠工资及加付赔偿金的风险。
三、员工提出离职的方式与经济补偿
员工主动提出离职：
- 如果员工因公司未按时支付工资而主动提出离职，并明确表示是基于公司未支付工资的原因，那么员工有权要求公司支付经济补偿。
员工被迫解除劳动合同：
- 在某些情况下，员工可能因公司未支付工资而被迫解除劳动合同（如通过发送被迫解除劳动合同通知书）。这种情况下，员工同样有权要求公司支付经济补偿，并且可能还有权要求公司支付拖欠的工资及加付赔偿金。
四、特殊情况下的经济补偿
公司破产或清算：
- 如果公司因经营困难进入破产或清算程序，员工的工资和经济补偿将按照破产法或清算程序的规定进行优先清偿。但这种情况下，员工可能需要通过法律程序来维护自己的权益。
双方协商一致：
- 如果公司和员工能够协商一致，就工资支付和经济补偿问题达成协议，那么可以按照协议执行。这种情况下，双方都需要遵守协议的约定。
五、建议与注意事项
- 保留证据：员工在提出离职前，应保留好与公司沟通工资支付问题的证据，如聊天记录、邮件、通知等，以便在需要时证明自己的权益。
- 及时咨询：如果员工对公司是否应支付经济补偿存在疑问，或者公司拒绝支付经济补偿，员工应及时咨询专业律师，了解自己的权益和维权途径。
- 合法维权：员工在维权过程中，应遵守法律法规，通过合法途径维护自己的权益，避免采取过激行为导致不必要的法律风险。
综上所述，公司因经营困难无法发放工资时，员工提出离职一般是有经济补偿的。但具体情形需结合实际情况分析，如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。