结论：病假期满后，若厂里协商解除劳动合同，经济补偿的计算基数通常是劳动者在劳动合同解除或终止前十二个月的平均工资，而非单纯按病假前或病假后的工资计算。不过，具体还需根据实际情况和法律规定来确定。
详细分析：
经济补偿的计算基数：
- 根据相关法律法规，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。这里的“月工资”是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资，它包含了劳动者在这段时间内的所有货币性收入，如基本工资、奖金、津贴、补贴等。
- 因此，在病假期满后协商解除劳动合同的情况下，经济补偿的计算基数并非单纯按病假前或病假后的工资计算，而是考虑劳动者在解除或终止劳动合同前十二个月的平均工资。
特殊情况下的处理：
- 如果劳动者在病假期间工资有所调整（如因病假工资低于正常工资水平），但这一调整是合法的，并且符合公司规章制度或劳动合同的约定，那么经济补偿的计算基数仍然会按照解除或终止前十二个月的平均工资来计算。
- 如果劳动者月工资高于当地上年度职工月平均工资三倍的，经济补偿标准将按职工月平均工资三倍的数额支付，且最高不超过十二年。这是法律对高收入劳动者经济补偿的一种限制。
违法解除的情况：
- 如果用人单位在病假期满后未经法定程序或未满足法定条件就解除劳动合同，即构成违法解除。在这种情况下，用人单位需要依照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
建议与注意事项：
- 了解自身权益：劳动者在病假期和解除劳动合同过程中享有法定的权益，包括经济补偿、医疗补助费等。劳动者应了解这些权益，并在必要时通过法律手段维护自己的合法权益。
- 保留相关证据：在协商解除劳动合同的过程中，劳动者应保留好与用人单位的沟通记录、工资单、劳动合同等相关证据，以便在发生争议时能够证明自己的主张。
- 咨询专业律师：如果劳动者对经济补偿的计算、解除劳动合同的程序等方面存在疑问或争议，建议直接向我咨询，我会根据具体情况提供专业的法律意见和帮助。
示例说明：
假设劳动者在病假期满前十二个月的平均工资为8000元，且在公司工作了5年。那么，在合法解除劳动合同的情况下，劳动者应获得的经济补偿为5个月工资，即40000元（8000元/月 × 5月）。如果用人单位违法解除劳动合同，则需要支付赔偿金80000元（40000元 × 2）。
希望以上分析能够对你有所帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。