结论：这种情况是否算作开除，取决于您填写离职申请的具体情形以及公司解除劳动合同的合法性，具体分析如下：
一、若公司解除劳动合同合法，且您填写离职申请是出于自愿或公司要求作为解除流程的一部分
公司解除劳动合同的合法性：
- 根据《劳动合同法》的相关规定，公司可以因员工严重违反公司规章制度而解除劳动合同。若您确实存在违反公司纪律的行为，且该行为达到了公司规章制度中规定的“严重违反”的标准，那么公司有权解除与您的劳动合同。
离职申请的作用：
- 在这种情况下，您填写的离职申请可能只是公司解除劳动合同流程中的一个环节，用于确认您已知悉并接受公司的解除决定。此时，离职申请并不改变公司解除劳动合同的实质，您仍被视为被开除。
二、若公司解除劳动合同不合法，或您填写离职申请并非出于自愿
公司解除劳动合同的不合法性：
- 如果公司解除劳动合同的行为缺乏合法依据，如您并未严重违反公司规章制度，或者公司解除劳动合同的程序不合法（如未提前通知、未支付经济补偿等），那么公司的解除行为可能构成违法解除。
离职申请的非自愿性：
- 若您填写离职申请并非出于自愿，而是受到公司胁迫、欺诈或误导等，那么该离职申请可能无效。在这种情况下，您实际上并未主动提出离职，而是被公司单方面解除劳动合同，应被视为被开除。
三、特殊情况：离职申请与解除劳动合同的先后顺序及影响
- 先解除后申请：如果公司先以您违反纪律为由解除劳动合同，之后您才填写离职申请（可能是为了办理离职手续或领取相关待遇），这并不影响您被开除的事实。
- 先申请后解除：如果您先填写了离职申请，但公司随后又以您违反纪律为由解除劳动合同（且该解除行为合法），那么您的离职性质可能因公司的后续行为而发生变化。然而，在大多数情况下，如果离职申请是您主动提出的，且公司解除劳动合同的行为与您的离职申请无直接关联，那么您的离职仍应被视为自愿离职。但若公司解除行为合法且与您之前的违纪行为有关，则可能仍构成开除，只是离职流程上有所重叠。
四、法律建议
- 核实解除合法性：首先，您需要核实公司解除劳动合同的行为是否合法，包括是否符合公司规章制度、是否遵循了法定程序等。
- 保留证据：无论您是否填写了离职申请，都应保留好与解除劳动合同相关的所有证据，如公司解除通知、规章制度、违纪事实证明等。
- 寻求法律帮助：如果您认为公司的解除行为不合法或存在争议，可以及时向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律建议和帮助。
总结：是否算作开除，需结合公司解除劳动合同的合法性、您填写离职申请的具体情形以及两者之间的关联性来综合判断。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。