公司可以对医疗期已满的抑郁症员工提出劳动能力鉴定，但需确保要求的合法性，并充分尊重员工的权利。以下从不同角度为您详细分析：
一、公司提出劳动能力鉴定的合法性与合理性
合法性：
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》，员工因患病（包括抑郁症）需停止工作医疗时，享有三个月到二十四个月的医疗期。医疗期满后，若员工不能从事原工作或用人单位另行安排的工作，公司有权提出劳动能力鉴定。
- 若抑郁症与工作相关，如长期高强度工作、职场霸凌等导致，在申请工伤认定过程中，劳动保障行政部门可能要求进行劳动能力鉴定。此时，公司要求员工配合鉴定是合理的。
- 但需注意：若员工未出现医疗期满不能工作等法定情形，公司仅因员工患抑郁症而随意要求鉴定，则可能侵犯员工合法权益，属于不合法行为。
合理性：
- 公司要求员工进行劳动能力鉴定，通常是为了评估劳动能力，合理安排工作，或处理工伤赔偿等事宜。这既是对员工负责，也是对企业运营负责的体现。
- 然而，公司应确保鉴定要求的合理性，避免对员工造成不必要的压力或歧视。
二、员工的权利和义务
权利：
- 知情权：员工有权了解公司要求进行劳动能力鉴定的原因、依据以及鉴定的具体流程和可能产生的后果。
- 选择权与参与权：员工可以选择符合资质的劳动能力鉴定机构，并在鉴定过程中提供真实、准确的信息和材料。同时，有权对鉴定结果提出异议。
- 获得赔偿权：若鉴定确认员工丧失或部分丧失劳动能力，员工有权根据相关法律法规获得相应的医疗待遇、经济补偿等。
义务：
- 配合鉴定：若公司的鉴定要求是合法合理的，员工有义务配合进行劳动能力鉴定，如实提供相关的病历、诊断证明等材料。
- 遵守程序：员工应按照鉴定机构的要求按时参加鉴定，并遵守鉴定过程中的各项规定。
三、劳动能力鉴定的流程与效力
鉴定流程：
- 提出申请：由用人单位、员工或其近亲属向设区的市级劳动能力鉴定委员会提出申请，并提供相关材料。
- 审核受理：劳动能力鉴定委员会对提交的材料进行审核，符合条件的予以受理。
- 组织鉴定：从医疗卫生专家库中随机抽取专家组成专家组，由专家组提出鉴定意见。
- 作出结论：根据专家组的鉴定意见作出劳动能力鉴定结论。
- 结论送达：及时将鉴定结论送达申请鉴定的单位和个人。
鉴定效力：
- 鉴定结论具有法律约束力，对于用人单位和劳动者双方均具有重要意义。
- 若双方对鉴定结论有异议，可按照规定程序申请重新鉴定。
四、后续处理与劳动保护
后续处理：
- 不影响劳动能力：员工可继续正常工作，公司应履行原劳动合同义务，不得歧视或不合理对待。
- 部分丧失劳动能力：公司可根据员工实际情况调整工作岗位，并确保员工能够胜任。员工可能享受医疗期延长、病假工资等待遇。
- 完全丧失劳动能力：员工可能需要退出工作岗位，享受相应的退休、退职待遇。具体标准按国家有关规定执行。
劳动保护：
- 医疗期内保护：根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条，员工在医疗期内，用人单位不得解除劳动合同。
- 医疗期满后处理：若员工医疗期满后仍无法继续工作，且经劳动能力鉴定确认，公司可依法解除劳动合同，但需提前三十日以书面形式通知员工或额外支付一个月工资。
建议：当公司要求患有抑郁症且医疗期已满的员工进行劳动能力鉴定时，员工应首先了解自己的权利和义务，配合合法的鉴定要求。同时，公司也应确保鉴定要求的合法性、合理性，并遵循相关法律法规处理后续事宜，以保障双方的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。