买卖电动自行车双方签有的转让协议，在符合特定条件下是具有法律效力的。以下是对这一结论的详细分析：

一、协议主体适格

1. 民事行为能力：签订转让协议的双方必须具备相应的民事行为能力。完全民事行为能力人（如十八周岁以上的自然人）可以独立签订协议；限制民事行为能力人（如八周岁以上不满十八周岁的自然人）需在法定代理人的同意或追认下签订；无民事行为能力人（如不满八周岁的自然人）则由法定代理人代为签订。
2. 真实意思表示：协议的签订必须是双方自愿且真实意愿的体现，不存在欺诈、胁迫、重大误解等情形。这确保了双方在平等、自愿的基础上达成交易。

二、协议内容合法

1. 不违反法律法规：转让协议的内容不得违反国家法律法规的强制性规定，否则协议无效。例如，不能约定转让非法来源的电动自行车或进行非法交易。
2. 不违背公序良俗：协议内容还需符合社会的公共秩序和善良风俗，不得损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益。

三、车辆合法性

转让的电动自行车必须来源合法，不属于被盗、抢劫等非法途径获得的车辆。这一点对于确保交易的合法性和安全性至关重要。如果车辆存在权利瑕疵，如被抵押、查封或存在其他权利限制，可能导致协议无效或无法履行。

四、协议形式符合要求

虽然法律对电动自行车转让协议的形式没有严格规定，但为了避免潜在的纠纷和风险，建议采用书面形式并明确以下内容：

• 双方的姓名、身份证号码、联系方式等基本信息；
• 电动自行车的品牌、型号、车架号码、电机号码等详细信息；
• 转让价格、付款方式、交付时间等关键条款；
• 车辆状况及可能存在的瑕疵说明；
• 违约责任及解决争议的方式等。

五、过户手续的重要性

虽然未办理过户手续不影响电动自行车转让协议的本身效力，但可能影响协议的对抗效力，即对第三人的法律约束力可能会受到限制。例如，如果车辆在未过户的情况下发生交通事故，原车主可能仍需承担一定的法律责任。因此，建议在签订转让协议后尽快办理过户手续，以确保买卖双方的合法权益得到充分保障。

六、实际案例与法律后果

在实际操作中，如果双方签订了合法有效的转让协议，并完成了交付和付款，但未办理过户手续，一旦车辆发生交通事故或被盗抢，可能会引发一系列法律纠纷。例如，买方可能因无法证明车辆所有权而面临赔偿困难；卖方则可能因车辆仍登记在自己名下而承担不必要的法律责任。因此，办理过户手续是确保交易安全、避免法律风险的重要步骤。

综上所述，买卖电动自行车双方签有的转让协议在符合上述条件的情况下具有法律效力。为了确保交易的合法性和安全性，建议双方在签订协议时务必谨慎考虑并遵守相关法律法规，同时尽快办理过户手续以确保权益得到充分保障。如果您在电动自行车买卖过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询。