事业单位合同工加班，一般是有权获得加班费的，但具体是否支付及支付标准需根据事业单位的性质、员工管理方式及单位规定来确定。以下是对此问题的详细分析：
一、事业单位性质与员工管理方式的影响
适用《劳动法》的事业单位：
- 对于实行企业化管理的事业单位，或与员工签订了劳动合同的事业单位，其员工加班应适用《劳动法》的相关规定。
- 根据《劳动法》第四十四条，用人单位在安排劳动者延长工作时间、休息日工作且不能安排补休、以及法定休假日工作时，需按照一定标准支付高于劳动者正常工作时间工资的工资报酬。
参照《公务员法》管理的事业单位：
- 对于参照《公务员法》管理的事业单位，其工作人员加班通常不适用《劳动法》关于加班费的规定。
- 这类单位的工作人员加班，一般按照《公务员法》的相关条款进行管理，如给予补休或按国家规定给予补助。
二、单位规定与具体情形的影响
单位规定：
- 事业单位在制定相关规章制度时，应明确加班费的支付标准和条件。
- 若单位有明确规定且符合加班情形，劳动者可主张加班费。
具体情形：
- 部分岗位因工作性质特殊，难以明确区分工作时间和加班时间，或已通过调休等方式合理安排，可能不支付加班费。
- 对于自愿加班且单位未明确规定给予加班费的情况，一般无法主张加班费。
三、法律建议与维权途径
了解单位规定：
- 劳动者在加班前应了解单位规定和相关法律法规，以便在必要时维护自己的权益。
与单位协商：
- 若认为自身加班权益受到侵害，首先可与单位进行沟通协商，尝试解决问题。
法律途径：
- 对于适用《劳动法》的事业单位员工，如果协商不成，可以通过劳动仲裁、诉讼等途径解决。
- 对于参照公务员法管理的事业单位工作人员，可以通过申诉等途径维护自身权益。
四、特殊工时制度与经费来源的影响
特殊工时制度：
- 部分事业单位可能实行不定时工作制或综合计算工时工作制，这些都需要经过劳动行政部门的批准。
- 在这样的制度下，加班费的计算和支付方式可能会有所不同，但仍需确保劳动者的合法权益得到保障。
经费来源和性质：
- 对于全额拨款的事业单位，虽然其经费主要来源于政府财政，但在加班费支付方面也不能违反《劳动法》的相关规定。
- 即使经费有限，也应通过合理安排工作时间和补休等方式，确保劳动者的合法权益。
总结与建议：事业单位合同工加班是否有权获得加班费，需综合考虑事业单位的性质、员工管理方式、单位规定以及具体情形。建议劳动者在加班前了解单位规定和相关法律法规，以便在必要时维护自己的权益。若遇到争议，可依据上述建议选择合适的法律途径来解决问题。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。