员工下班检查后备箱是否合法，需结合具体情况来判断，一般而言，若检查行为合理且不侵犯员工权益，则合法；反之，则可能不合法。以下从不同角度进行分析：
合法情况
公司规章制度允许：
- 如果公司有明确的规章制度，规定员工在下班时需要接受安全检查，包括检查后备箱等，且该规章制度已经过民主程序制定并公示，员工也已知悉并同意，那么这种检查行为是合法的。
- 法律依据：根据《劳动合同法》第四条，用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
基于安全考虑：
- 如果公司出于安全考虑，如防止员工携带危险物品进入工作场所，从而要求检查后备箱，且检查方式合理、不侵犯员工隐私，那么这种检查也是合法的。
- 实际案例：在某些特殊行业，如化工、易燃易爆品生产等，公司可能会要求员工在下班时接受安全检查，以确保工作场所的安全。
不合法情况
侵犯员工隐私：
- 如果公司检查后备箱的行为侵犯了员工的隐私权，如未经员工同意擅自打开后备箱检查，或者检查过程中泄露了员工的个人物品信息，那么这种检查行为是不合法的。
- 法律依据：根据《民法典》第一千零三十二条，自然人享有隐私权。任何组织或者个人不得以刺探、侵扰、泄露、公开等方式侵害他人的隐私权。隐私是自然人的私人生活安宁和不愿为他人知晓的私密空间、私密活动、私密信息。
无合理理由：
- 如果公司没有合理的理由要求检查后备箱，或者检查行为超出了必要的限度，如对所有员工进行无差别的、频繁的检查，那么这种检查行为也可能被视为不合法。
- 实际建议：公司应当基于合理的安全考虑或管理需要来制定检查政策，并确保检查行为不侵犯员工的合法权益。
特殊情况
- 员工自愿接受检查：如果员工自愿接受后备箱检查，且没有表示异议，那么这种检查行为通常是合法的。但需要注意的是，员工的自愿接受并不意味着公司可以随意侵犯其隐私权或其他合法权益。
总结与建议：
- 对于公司而言，应当制定合理的检查政策，明确检查的目的、范围和方式，并确保该政策已经过民主程序制定并公示。同时，公司应当尊重员工的隐私权和其他合法权益，避免过度检查或侵犯员工权益。
- 对于员工而言，如果认为公司的检查行为不合法或侵犯了自己的权益，可以与公司进行沟通协商，或者向劳动监察部门投诉举报。
如果有任何具体的劳动纠纷问题，比如遇到不合理的检查行为或权益受到侵害，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律建议。