员工欠公司借款，申请用工资抵账是否合法，需分情况讨论：

1. 若双方协商一致：

   • 根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，当事人有权在法律允许的范围内自由处分自己的民事权利。因此，如果员工与公司就工资抵账事宜达成了书面或口头的协议，并且该协议不违反法律法规的强制性规定，不损害国家、集体或第三人的利益，那么这种抵账方式是合法的。
   • 建议：为确保协议的合法性和有效性，双方最好签订书面协议，明确抵账的金额、方式、时间等关键条款。

2. 若未经协商或协商未果：

   • 员工单方面决定用工资抵账，可能构成对公司财产权的侵犯。因为工资是员工提供劳动后应得的报酬，属于员工的合法财产权。未经公司同意，员工无权擅自处分自己的工资。
   • 法律后果：公司有权拒绝员工的抵账要求，并可能通过法律途径追究员工的法律责任，如要求员工返还借款或赔偿损失。
   • 建议：在这种情况下，员工应与公司进行积极沟通，寻求双方都能接受的解决方案。如果沟通无果，员工可以考虑通过法律途径解决纠纷，但应谨慎行事，避免给自己带来不必要的法律风险。

3. 特殊情况下的合法性：

   • 如果员工与公司之间的借款关系本身存在争议（如借款金额、借款用途等），或者公司存在违法行为（如未按时足额支付工资、违反劳动合同等），那么员工用工资抵账的合法性可能会受到影响。
   • 建议：在这种情况下，员工应首先解决借款关系或公司违法行为的争议，再考虑用工资抵账的问题。如果争议无法通过协商解决，员工可以寻求法律援助或提起诉讼。

额外提醒：

• 员工在处理与公司之间的借款和工资问题时，应始终保持谨慎和理性。避免因一时冲动而采取过激行为，给自己带来不必要的法律风险。
• 如果员工对法律问题存在疑问或不确定如何处理，可以直接向我咨询。我会根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。