包地合同中写明土地承包款在签订合同时一次性付清，这一条款本身在法院并不能直接证明已经付清承包款。以下从不同角度对此问题进行分析：
合同条款与实际履行的区别
合同条款的证明力：合同中的条款是双方约定的权利和义务，它规定了付款的方式和时间。然而，合同条款本身只是双方达成合意的书面表达，并不直接证明款项已经实际支付。
实际履行的证明：要证明承包款已经付清，需要提供实际履行的证据，如银行转账记录、收据、付款凭证等。这些证据能够直接证明款项的流动和支付情况。
法院审查的重点
证据的真实性：在诉讼中，法院会审查双方提供的证据的真实性。如果只有合同条款而没有其他实际履行的证据，法院可能无法确认款项已经支付。
证据的充分性：除了真实性外，法院还会审查证据的充分性。即，提供的证据是否足以证明款项已经按照合同约定支付。如果证据不足，法院可能无法支持已付款的主张。
可能的法律后果
如果无法证明已付款：如果承包方无法提供充分的证据证明已经支付了承包款，而发包方又否认收到款项，那么承包方可能面临违约的风险，需要承担相应的法律责任。
如果能够证明已付款：相反，如果承包方能够提供充分的证据证明已经支付了承包款，那么其主张将得到法院的支持，无需承担违约责任。
建议与措施
保留付款凭证：在签订包地合同并支付承包款时，务必保留好付款凭证，如银行转账记录、收据等。这些凭证是证明款项已经支付的关键证据。
完善合同条款：虽然合同条款本身不能直接证明款项已经支付，但可以在合同中约定违约责任和争议解决方式，以便在发生纠纷时能够更好地维护自己的权益。
及时咨询律师：如果在包地合同履行过程中遇到任何问题或纠纷，建议及时咨询专业律师，以便得到专业的法律建议和帮助。
总结来看，包地合同中写明土地承包款在签订合同时一次性付清，并不能直接证明款项已经付清。要证明这一点，需要提供实际履行的证据。在诉讼中，法院会审查证据的真实性和充分性，以作出公正的裁决。因此，建议在签订和履行包地合同时，务必保留好相关证据，并及时咨询专业律师以维护自己的权益。