在起诉时公司名称为A公司，后改名为B公司的情况下，判决书中的表述应当准确反映公司名称的变更情况，具体写法可以参考以下建议：
在判决书的事实查明部分明确公司名称变更：
- 判决书在叙述案件事实时，应当详细记录公司名称的变更过程。例如，可以表述为：“被告公司原名为A公司，于XXXX年XX月XX日经工商行政管理部门核准，变更为现名B公司。”这样的表述既清晰又准确，有助于法院和当事人理解案件背景。
在判决主文部分使用现用公司名称：
- 在判决主文（即法院对案件实体问题作出的处理决定部分）中，应当使用公司变更后的名称B公司。这是因为判决主文是对当前法律关系的确认和调整，应当以公司当前的法律状态为准。
附注或说明部分补充变更信息（如适用）：
- 如果判决书格式允许，可以在附注或说明部分进一步补充公司名称变更的详细信息，如变更时间、变更原因等。这有助于增强判决书的完整性和可读性。
法律依据与考量：
- 根据《中华人民共和国公司法》及相关司法解释，公司名称的变更不影响其民事权利和义务的承担。因此，在判决书中准确反映公司名称的变更情况，是遵循法律规定、保障当事人合法权益的必要举措。
- 同时，从实践角度来看，清晰、准确地记录公司名称变更情况，有助于避免因名称混淆而导致的执行困难或法律纠纷。
实际操作建议：
- 在准备起诉材料或参与诉讼过程中，如果发现公司名称发生变更，应及时向法院提交相关证明材料（如工商变更登记证明等），以确保判决书中公司名称的准确性。
- 如果在诉讼过程中公司名称发生变更，也应及时通知法院和对方当事人，以便法院在判决书中作出相应调整。
总结与提醒：
- 判决书中的公司名称应当与公司当前的法律状态保持一致。
- 在起诉或诉讼过程中发现公司名称变更的，应及时向法院提交相关证明材料并通知对方当事人。
- 如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。