合伙公司亏损时，股东降低工资是否合法，需分情况讨论：

1. 若股东同时担任公司员工，且工资调整有合法依据：

   • 合法情形：根据《中华人民共和国劳动合同法》及相关规定，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括工资。因此，如果股东作为员工，与公司就工资调整达成一致，且调整后的工资不低于当地最低工资标准，那么这种降低工资的行为是合法的。
   • 建议：在此情况下，建议公司与股东员工签订书面的工资变更协议，明确调整后的工资数额、支付时间等关键条款，以避免后续纠纷。

2. 若股东未担任公司员工，或工资调整无合法依据：

   • 不合法情形：如果股东并非公司员工，或者作为员工但公司未经其同意单方面降低工资，且降低后的工资低于当地最低工资标准，那么这种行为是不合法的。股东有权要求公司按照原工资标准支付工资，并可能通过法律途径维护自己的权益。
   • 法律后果：公司可能面临劳动监察部门的处罚，包括责令支付拖欠的工资、加付赔偿金等。同时，股东也可能因此对公司失去信任，影响公司的稳定和运营。

3. 合伙协议或公司章程有特别约定：

   • 需遵循约定：如果合伙协议或公司章程中明确规定了在公司亏损时股东工资的调整方式或标准，那么公司应按照这些约定来执行。这种情况下，即使股东对工资调整有异议，也需要遵循协议或章程的规定。
   • 建议：在制定合伙协议或公司章程时，应充分考虑各种可能的情况，包括公司亏损时的工资调整问题，以避免后续纠纷。

额外建议：

• 沟通协商：在公司亏损时，股东之间以及股东与公司之间应加强沟通协商，共同寻找解决问题的办法。通过协商达成一致的工资调整方案，有助于维护公司的稳定和股东的权益。
• 法律咨询：如果股东对工资调整问题有疑问或争议，建议及时咨询专业律师，了解自己的权益和义务，以及可能的法律后果。

总结：合伙公司亏损时股东降低工资是否合法，取决于股东是否同时担任公司员工、工资调整是否有合法依据以及合伙协议或公司章程是否有特别约定。在处理此类问题时，应遵循相关法律法规和协议约定，通过沟通协商解决争议。如有需要，可直接向我咨询相关法律问题。