结论是：按揭房款已还清后，若发现借款合同章子有问题，是否追究责任需视具体情况而定，包括合同章子问题的性质、是否造成实际损失以及是否在诉讼时效内等因素。

一、合同章子问题的性质

1. 合同章子真实但存在瑕疵：

   • 如果合同上的章子确实是真实的，只是存在如盖章位置不准确、章子模糊等瑕疵，且这些瑕疵并未影响合同的实质内容和双方的权利义务，那么通常不会因此追究责任。因为合同的效力主要取决于其内容是否合法、双方意思表示是否真实，而非章子的完美程度。

2. 合同章子为伪造或变造：

   • 如果合同上的章子是伪造或变造的，那么情况就严重了。这可能构成欺诈行为，甚至可能涉及刑事犯罪。在此情况下，无论房款是否已还清，受害方都有权追究相关责任人的法律责任，包括要求赔偿损失、撤销合同等。

二、是否造成实际损失

1. 未造成实际损失：

   • 如果合同章子的问题并未导致任何实际损失，比如双方已经按照合同约定履行了各自义务，且房款已还清，那么即使合同章子存在问题，也可能不会因此追究责任。因为法律通常更关注实际损害的发生和赔偿。

2. 造成实际损失：

   • 如果合同章子的问题导致了实际损失，比如因为章子问题导致合同无效或被撤销，进而使得一方遭受了经济损失，那么受害方有权要求赔偿。在此情况下，无论房款是否已还清，都需要根据实际情况追究相关责任人的法律责任。

三、是否在诉讼时效内

• 无论合同章子问题是否导致了实际损失，如果受害方想要追究责任，都需要在诉讼时效内提起诉讼或仲裁。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间通常为三年。如果超过了诉讼时效期间，那么受害方可能丧失了胜诉权。

四、建议与措施

1. 核实合同章子的真实性：

   • 如果发现合同章子有问题，首先应核实其真实性。可以通过与合同相对方沟通、查询相关记录或聘请专业机构进行鉴定等方式来确认。

2. 评估实际损失：

   • 如果合同章子的问题可能导致实际损失，那么应尽快评估损失的大小和范围。这有助于确定后续的法律行动和赔偿要求。

3. 及时采取法律行动：

   • 如果确认合同章子存在问题且可能导致了实际损失，那么应及时采取法律行动。可以咨询专业律师，了解具体的法律程序和赔偿要求，并在诉讼时效内提起诉讼或仲裁。

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