结论先行：针对您房贷还清后发现贷款合同担保章子有问题的情况，这可能涉及到合同效力、担保责任以及后续处理等多个法律层面的问题。下面我将从这几个方面为您详细分析。
一、合同效力问题
担保章子问题的性质：
- 首先，需要明确担保章子的问题具体是什么，是章子本身存在瑕疵（如伪造、过期等），还是盖章的位置、方式等不符合合同约定或法律规定。
- 担保章子的问题可能影响到担保条款的效力，但不一定直接导致整个贷款合同无效。根据《民法典》的相关规定，合同部分无效，不影响其他部分效力的，其他部分仍然有效。
对合同效力的影响：
- 如果担保章子的问题严重到足以影响担保条款的效力，且该担保条款是合同的重要组成部分，那么可能对合同的整体效力产生一定影响。但具体还需结合合同内容、双方约定以及法律规定来判断。
- 在实践中，法院通常会根据合同的实际情况、双方当事人的意思表示以及法律规定来综合判断合同的效力。
二、担保责任问题
担保责任的承担：
- 如果担保章子的问题导致担保条款无效或可撤销，那么担保人可能无需承担担保责任。但这也取决于担保人是否存在过错以及过错程度。
- 根据《民法典》的相关规定，担保合同被确认无效后，债务人、担保人、债权人有过错的，应当根据其过错各自承担相应的民事责任。
对您的权益影响：
- 如果担保条款无效，且您作为债权人（在房贷关系中，银行通常是债权人，但此处假设您是从银行角度考虑或问题表述有误，实际您应为债务人，不过为全面分析，仍按债权人角度阐述）无法从担保人处获得赔偿，那么您的债权可能面临无法完全实现的风险。
- 但如果您作为债务人，且担保条款无效并非由您造成，那么您可能无需承担因担保无效而产生的额外责任。不过，这还需结合具体情况和法律规定来判断。
三、后续处理建议
核实担保章子问题：
- 首先，您需要核实担保章子的具体问题，包括章子的真实性、有效性以及盖章是否符合合同约定等。
- 您可以要求银行提供担保章子的相关证明文件，或者委托专业机构进行鉴定。
与银行协商：
- 在核实问题后，您可以与银行进行协商，就担保章子的问题以及可能产生的后果进行沟通。
- 您可以要求银行提供解决方案，如重新签订担保合同、提供其他担保方式等。
寻求法律帮助：
- 如果与银行协商无果，或者您认为自己的权益受到侵害，那么您可以寻求法律帮助。
- 您可以咨询专业律师，了解自己的法律权益和可能的维权途径。律师会根据您的具体情况，为您提供专业的法律建议和帮助。
最后，房贷还清后发现贷款合同担保章子有问题是一个比较复杂的问题，涉及到合同效力、担保责任以及后续处理等多个方面。因此，我建议您在处理此类问题时，务必保持谨慎和理性，及时寻求专业法律帮助，以维护自己的合法权益。如果您有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。