结论是：在殴打他人并做了笔录、司法申请鉴定的情况下，双方仍然有可能和解。以下是从不同角度对此问题的详细分析：
一、法律背景与和解的可能性
法律不禁止和解：在民事纠纷或轻微的刑事案件中，法律并不禁止双方当事人在案件处理过程中进行和解。和解是双方自愿、平等协商的结果，有助于化解矛盾，减少诉讼成本。
和解的效力：一旦双方达成和解协议，并履行了协议内容，那么该案件可能就此了结，不再继续进行司法程序（当然，这需要看具体案件性质和司法机关的态度，对于刑事案件，和解可能影响量刑但不一定能完全终止程序）。在民事侵权案件中，和解协议通常具有法律效力，双方应遵守。
二、和解的条件与流程
双方自愿：和解的首要条件是双方自愿，任何一方不得强迫对方接受和解条件。
平等协商：双方应在平等的基础上进行协商，确保和解条件公平合理。
达成书面协议：为了确保和解的效力，双方最好签订书面和解协议，明确各自的权利和义务。
履行协议：和解协议达成后，双方应按照协议内容履行各自的义务。
三、和解对司法程序的影响
对民事案件的影响：在民事侵权案件中，如果双方达成和解并履行了协议，原告可以向法院申请撤诉，案件就此终结。
对刑事案件的影响：在刑事案件中，和解可能作为量刑的一个考虑因素。如果犯罪嫌疑人积极赔偿被害人损失并取得谅解，法院在量刑时可能会予以从轻或减轻处罚。但需要注意的是，刑事案件的和解并不能完全终止司法程序，除非案件性质轻微且符合撤案条件。
四、和解的注意事项
确保和解协议合法有效：和解协议的内容应合法，不得违反法律、行政法规的强制性规定，也不得损害国家、集体或第三人的利益。
考虑未来可能的风险：在达成和解协议前，双方应充分考虑未来可能出现的风险，如协议履行过程中的违约问题等，并在协议中约定相应的违约责任和解决方式。
寻求专业法律帮助：由于和解涉及法律问题，双方在协商过程中可以寻求专业律师的帮助，以确保和解协议的合法性和有效性。
建议：如果您或对方希望和解，可以主动与对方沟通，表达和解的意愿，并在平等、自愿的基础上进行协商。如果需要，可以寻求我的专业法律帮助，以确保和解过程的顺利进行和和解协议的合法有效。