关于两辆车在同一起事故中的停运损失能否同案同判的问题，结论并非绝对，需根据具体情况分析。以下从不同角度进行详细阐述：

1. 法律原则与停运损失的性质

停运损失属于间接损失，通常指因事故导致车辆无法正常运营而产生的经济损失。根据《中华人民共和国民法典》及相关司法解释，侵权人需赔偿因侵权行为造成的合理停运损失。但“同案同判”需满足以下前提：

• 损失计算标准一致：两辆车的停运损失需基于相同的计算依据（如行业平均利润、运营成本等），且证据充分（如维修记录、运营合同等）。
• 责任比例相同：若两辆车在事故中责任比例一致（如均为无责或同等责任），则停运损失可能按责任比例分摊后同案处理。
• 无特殊免责情形：若其中一方存在免责事由（如车辆未年检、驾驶员无证驾驶等），则其停运损失可能不被支持或需扣减。

2. 可能不同案同判的情形

即使在同一事故中，以下情况可能导致停运损失判决不同：

• 车辆性质差异：若一辆车为营运车辆（如出租车、货车），另一辆为非营运车辆（如私家车），则停运损失的计算方式和赔偿范围可能不同。营运车辆的停运损失通常更高，需提供运营收入证明。
• 损失证据充分性：若一方能提供完整的停运损失证据（如维修时间证明、运营记录、税务发票等），而另一方证据不足，则法院可能仅支持证据充分一方的诉求。
• 保险覆盖情况：若其中一方投保了停运损失险，而另一方未投保，则保险公司可能对投保方进行赔偿，导致实际赔偿金额不同。

3. 司法实践中的考量因素

法院在判决时会综合以下因素：

• 公平性原则：确保两辆车的损失赔偿与其实际受损程度相当，避免“一刀切”。
• 证据规则：根据《民事诉讼法》及相关司法解释，停运损失需由主张方举证，证据不足的一方可能承担不利后果。
• 类案参考：法院可能参考同地区、同类型案件的判决，但类案仅具参考价值，非强制适用。

4. 法律建议

• 及时固定证据：事故发生后，两辆车均应保留维修记录、运营合同、收入证明等材料，以支持停运损失主张。
• 协商或诉讼策略：若双方损失差异较大，可协商分案处理；若坚持同案处理，需在诉讼中明确损失计算标准及责任比例。
• 咨询专业律师：停运损失的计算和举证具有专业性，建议委托律师协助处理，以提高胜诉率。

总结：两辆车在同一起事故中的停运损失能否同案同判，需结合损失计算标准、责任比例、证据充分性等因素综合判断。若您涉及此类纠纷，可直接向我咨询，我将根据具体案情提供专业法律意见。