用人单位在招聘时未明确要求学历层次，后续发现应聘者学历问题，一般不能直接解除劳动合同。以下从不同角度为您详细分析：

1. 劳动合同的合法性与有效性

• 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动合同的订立应当遵循合法、公平、平等自愿、协商一致、诚实信用的原则。用人单位在招聘时未明确要求学历层次，意味着学历并非该岗位的必要条件或双方未就学历问题达成特别约定。
• 在此情况下，应聘者提供的学历信息即使与用人单位后续期望的学历不符，也不构成对劳动合同根本性条款的违反，因此用人单位不能直接以此为由解除劳动合同。

2. 用人单位解除劳动合同的法定情形

• 《中华人民共和国劳动合同法》第三十九条规定了用人单位可以解除劳动合同的几种情形，如劳动者在试用期间被证明不符合录用条件、严重违反用人单位的规章制度、严重失职或营私舞弊给用人单位造成重大损害等。
• 学历问题并不直接等同于上述法定情形中的任何一种。除非用人单位能够证明学历是该岗位的明确且必要的录用条件，且应聘者在入职时故意隐瞒或提供虚假学历信息，否则用人单位不能仅凭学历问题解除劳动合同。

3. 实际操作中的建议

• 完善招聘流程：用人单位在招聘时应明确岗位的学历要求，并在招聘公告或面试过程中明确告知应聘者。这有助于避免后续因学历问题产生的纠纷。
• 签订劳动合同时明确条款：在签订劳动合同时，用人单位可以与劳动者就学历问题达成特别约定，如明确岗位所需的学历层次或专业背景等。这样，在后续发现学历问题时，用人单位可以依据合同条款进行处理。
• 合法合规解除劳动合同：如果用人单位确实需要因学历问题解除劳动合同，应确保解除行为符合法律法规的规定。例如，可以与劳动者协商一致解除劳动合同，或者依据劳动合同中约定的解除条件进行解除。在解除过程中，用人单位应依法支付经济补偿金等费用。

4. 可能的法律后果

• 如果用人单位未经合法程序或未依据合同条款擅自解除劳动合同，可能面临劳动争议仲裁或诉讼的风险。在仲裁或诉讼过程中，用人单位需要承担举证责任，证明其解除行为的合法性和合理性。
• 如果用人单位无法提供充分证据支持其解除行为，可能面临败诉的风险，并需要承担相应的法律责任，如支付违法解除劳动合同的赔偿金等。

总结与建议：用人单位在招聘时应明确学历要求，并在签订劳动合同时就学历问题达成特别约定。如果后续发现应聘者学历问题，应依法合规进行处理，避免擅自解除劳动合同带来的法律风险。如果您在处理此类问题时遇到困难或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。