结论：房东借你100万，约定按月息3分算，并用利息抵扣房租费，这一做法在法律上存在合法与不合法两种情况，具体取决于利息的约定是否超过了法定上限。

分析如下：

1. 利息的合法性：

   • 根据《最高人民法院关于审理民间借贷案件适用法律若干问题的规定》，民间借贷的利率受到法律保护的上限是合同成立时一年期贷款市场报价利率（LPR）的四倍。如果月息3分（即年利率36%）超过了这一上限，那么超出的部分将不受法律保护，借款人（即你）有权拒绝支付超出部分的利息。
   • 举例来说，如果当前一年期LPR为3.85%，那么其四倍即为15.4%。若约定的年利率为36%，则明显超出了这一上限，超出的20.6%将不受法律保护。

2. 利息抵扣房租的合法性：

   • 利息抵扣房租这一做法本身并不违法，但前提是利息的约定必须合法。如果利息约定合法，且双方达成一致意见，那么用利息抵扣房租是可行的。
   • 然而，如果利息约定超过了法定上限，那么超出的部分不仅不能用于抵扣房租，还可能引发法律纠纷。房东可能无法通过法律手段追讨超出部分的利息，而你也可能因此面临不必要的法律风险。

3. 实际操作建议：

   • 在与房东签订借款合同时，务必明确约定利息的计算方式和上限，确保不超过法定标准。
   • 如果双方同意用利息抵扣房租，也应在合同中明确约定抵扣的方式、时间和金额等细节，以避免后续纠纷。
   • 如果对利息的合法性或抵扣方式存在疑问，建议咨询专业律师或相关机构，以确保自身权益得到保障。

可能后果：

• 如果利息约定合法且双方达成一致意见，那么用利息抵扣房租将不会引发法律纠纷。
• 如果利息约定超过了法定上限，房东可能无法通过法律手段追讨超出部分的利息，而你也可能因此面临房东的不满或法律纠纷。

总结：房东借你100万，约定按月息3分算，并用利息抵扣房租费，这一做法的合法性取决于利息的约定是否超过了法定上限。为了确保自身权益得到保障，建议你在签订合同时明确约定利息的计算方式和上限，并咨询专业律师或相关机构的意见。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。