被诉行政机关的副职负责人是可以出庭应诉的。以下从多个角度对此问题进行详细分析：

一、法律依据与出庭应诉原则

根据《中华人民共和国行政诉讼法》第三条第三款及最高人民法院《关于行政机关负责人出庭应诉若干问题的规定》，被诉行政机关负责人应当出庭应诉。这里的“行政机关负责人”不仅包括正职负责人（如局长、厅长等），也涵盖了副职负责人（如副局长、副厅长等），以及其他参与分管被诉行政行为实施工作的副职级别的负责人和其他参与分管的负责人。这一规定确立了行政机关负责人出庭应诉为一项原则，旨在通过直接面对行政相对人，就行政行为的合法性等问题进行陈述、答辩和辩论，全面、准确地向法庭阐述行政机关的立场和依据。

二、副职负责人出庭应诉的合理性

1. 职责所在：副职负责人作为行政机关的重要组成部分，参与分管了被诉行政行为的实施工作，因此他们出庭应诉是职责所在，也是对司法权威的尊重。
2. 促进矛盾化解：副职负责人出庭应诉，有助于直接了解行政相对人的诉求和意见，从而更有效地促进矛盾的实质性化解。
3. 推进依法行政：通过出庭应诉，副职负责人可以更加直观地感受到法律对行政行为的约束和要求，进而推动行政机关依法行政水平的提升。

三、应当出庭应诉的情形

虽然副职负责人可以出庭应诉，但在某些特定情形下，他们更应当出庭。这些情形包括：

1. 涉及重大公共利益或社会高度关注的案件：如食品药品安全、生态环境和资源保护、公共卫生安全等领域的案件，以及可能引发群体性事件的案件。在这些案件中，副职负责人出庭应诉可以更好地向社会公众展示行政机关的立场和态度，增强公众对行政机关的信任。
2. 人民法院书面建议出庭的案件：在某些特定情形下，如被诉行政行为涉及公民、法人或其他组织重大人身、财产权益，或属于行政公益诉讼等，人民法院也可以通知行政机关负责人（包括副职负责人）出庭应诉。

四、不能出庭的处理与责任

如果副职负责人因正当理由（如不可抗力、意外事件、需要履行他人不能代替的公务等）无法出庭，他们可以提交相关证明材料，并加盖行政机关印章或由该机关主要负责人签字认可，同时申请延期开庭审理。然而，如果副职负责人无正当理由未出庭应诉，人民法院可以向监察机关、被诉行政机关的上一级行政机关提出司法建议，并在裁判文书中载明相关情况。此外，无正当理由拒不到庭或未经法庭许可中途退庭的，人民法院可以缺席判决，这增加了行政机关败诉的风险。

五、建议与注意事项

1. 提前准备：副职负责人在出庭应诉前，应充分了解案件情况，准备相关证据材料，并熟悉相关法律法规和政策。
2. 积极应诉：在庭审过程中，副职负责人应积极陈述、答辩和辩论，全面、准确地向法庭阐述行政机关的立场和依据。
3. 尊重法庭：副职负责人应尊重法庭的权威和判决结果，积极履行法庭确定的义务和责任。

总结来看，被诉行政机关的副职负责人是可以且在某些情况下应当出庭应诉的。这不仅是对司法权威的尊重，也有助于矛盾的实质性化解和依法行政的推进。如果您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。