被诉行政机关负责人在行政诉讼中应当出庭应诉，这是法律明确规定的义务。以下从多个角度对此进行详细分析：
法律依据与出庭应诉的原则
- 根据《中华人民共和国行政诉讼法》第三条第三款，被诉行政机关负责人应当出庭应诉。这一规定确立了行政机关负责人出庭应诉为一项原则，旨在通过直接面对行政相对人，就行政行为的合法性等问题进行陈述、答辩和辩论，全面、准确地向法庭阐述行政机关的立场和依据。
行政机关负责人的范围
- 行政机关负责人包括正职负责人（如局长、厅长等）、副职负责人（如副局长、副厅长等）以及参与分管被诉行政行为实施工作的副职级别的负责人和其他参与分管的负责人。这些人员均负有出庭应诉的义务。
应当出庭应诉的情形
- 涉及重大公共利益或社会高度关注的案件，如食品药品安全、生态环境和资源保护、公共卫生安全等领域的案件，以及可能引发群体性事件的案件，人民法院应当通知行政机关负责人出庭应诉。
- 人民法院书面建议出庭的案件，如被诉行政行为涉及公民、法人或其他组织重大人身、财产权益，或属于行政公益诉讼等。
不能出庭的处理与责任
- 若因不可抗力、意外事件、需要履行他人不能代替的公务等无法出庭的正当事由，行政机关负责人可以不出庭，但需提交相关证明材料，并加盖行政机关印章或由该机关主要负责人签字认可，同时可以申请延期开庭审理。
- 若行政机关负责人无正当理由未出庭应诉，人民法院可以向监察机关、被诉行政机关的上一级行政机关提出司法建议，并在裁判文书中载明相关情况。此外，行政机关负责人无正当理由拒不到庭，或者未经法庭许可中途退庭的，人民法院可以缺席判决，增加行政机关败诉的风险。
出庭应诉的意义
- 行政机关负责人出庭应诉，不仅体现了对司法权威的尊重，也有助于矛盾的实质性化解和依法行政的推进。通过直接面对行政相对人，行政机关负责人可以更全面地了解案件情况，更准确地阐述行政机关的立场和依据，从而更有效地解决行政争议。
原告的应对措施
- 实践中，还是有很多行政机关负责人不愿意出庭应诉。作为原告，不能被动地等到开庭才去提出异议，在庭前申请法院督促负责人出庭，也是一个有效的办法。
综上所述，被诉行政机关负责人在行政诉讼中应当出庭应诉，这是法律明确规定的义务。行政机关应当严格遵守这一规定，确保在行政诉讼中充分履行职责，维护法治秩序和社会稳定。如果您在行政诉讼中遇到相关问题，或者对行政机关负责人出庭应诉有进一步的疑问，可以直接向我咨询。