在政府采购协议结束而新的协议还未完成的情况下，可以采取以下措施来应对：

1. 继续履行原协议中的合理延续条款：

   • 如果原政府采购协议中有关于协议期满后自动延续或续签的相关条款，且这些条款在法律上有效且未违反相关规定，那么双方可以继续按照原协议的条款履行义务，直至新协议签订。这要求仔细审查原协议，确认是否存在此类条款，并评估其法律效力。

2. 协商签订临时协议或补充协议：

   • 在原协议期满而新协议尚未签订的情况下，双方可以协商签订一份临时协议或补充协议，以明确在过渡期间双方的权利和义务。这种临时协议或补充协议应尽可能详细地规定服务内容、价格、支付方式、违约责任等关键条款，以确保双方权益得到保障。

3. 遵循政府采购法律法规的规定：

   • 根据《中华人民共和国政府采购法》及相关法律法规的规定，政府采购活动应当遵循公开透明原则、公平竞争原则、公正原则和诚实信用原则。在协议期满而新协议未签订的情况下，双方应确保采购活动的连续性和稳定性，避免因协议空白期而导致的法律风险。
   • 具体来说，如果因特殊情况需要延长原协议期限或签订新协议，应按照法定程序进行，如公开招标、竞争性谈判等，以确保采购活动的合法性和合规性。

4. 考虑紧急采购或单一来源采购的适用性：

   • 在某些紧急情况下，如自然灾害、突发事件等，可能需要立即进行采购以满足紧急需求。此时，可以考虑适用紧急采购程序或单一来源采购方式，但应确保符合相关法律法规的规定，并经过必要的审批程序。

5. 加强沟通与协调，尽快签订新协议：

   • 双方应加强沟通与协调，尽快就新协议的条款达成一致意见，并签订新协议。这有助于避免协议空白期带来的不确定性和风险，确保政府采购活动的顺利进行。

可能面临的法律后果及建议：

• 如果双方在原协议期满后未采取任何措施，导致政府采购活动出现中断或停滞，可能会面临法律责任和声誉损失。因此，建议双方在协议期满前就开始协商新协议的签订事宜，以确保采购活动的连续性和稳定性。
• 如果双方在协商过程中出现争议或无法达成一致意见，可以考虑通过调解、仲裁或诉讼等法律途径解决争议。但在此之前，应尽可能通过友好协商的方式解决问题，以维护双方的合作关系和声誉。

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