结论：员工在工作两年未签订劳动合同的情况下离职，是否需要签订解除劳动合同协议，需根据具体情况判断。若双方就离职补偿、工作交接等事项达成一致，建议签订协议以明确权利义务；若无法达成一致或存在争议，则无需签订，并可通过法律途径解决。
一、未签订劳动合同的法律后果
根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位自用工之日起超过一个月不满一年未与劳动者订立书面劳动合同的，应当向劳动者每月支付二倍的工资。对于您的情况，员工已经工作两年未签订劳动合同，用人单位实际上已经违反了法律规定，并可能需要承担支付双倍工资等法律责任。然而，这一法律后果与是否需要签订解除劳动合同协议并无直接关联，但它是理解整个问题背景的重要前提。
二、是否需要签订解除劳动合同协议
双方协商一致的情况：
- 如果员工与用人单位就离职补偿、工作交接、保密义务等事项达成了一致意见，那么签订一份解除劳动合同协议是有益的。这份协议可以明确双方的权利和义务，避免未来可能出现的纠纷。
- 协议内容应包括离职日期、补偿金额及支付方式、工作交接的具体安排、保密条款等。
双方存在争议或无法达成一致的情况：
- 如果员工与用人单位在离职补偿、工作交接等方面存在争议，或者无法就相关事项达成一致意见，那么签订解除劳动合同协议可能并不是必要的。
- 在这种情况下，员工可以选择通过法律途径（如劳动仲裁）来解决争议，维护自己的合法权益。
三、法律建议
对于员工：
- 在离职前，尽量与用人单位就离职补偿、工作交接等事项进行协商，并尝试签订一份解除劳动合同协议以明确双方的权利和义务。
- 如果无法达成一致意见，或者用人单位存在违法行为（如未支付双倍工资等），员工可以向当地劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁来维护自己的权益。
对于用人单位：
- 用人单位应尽快与员工补签劳动合同或签订解除劳动合同协议，以明确双方的权利和义务，避免未来可能出现的法律纠纷。
- 如果员工提出离职申请，用人单位应依法支付经济补偿（如果符合法定条件），并妥善处理工作交接等事宜。
四、可能的法律后果
- 如果双方签订了解除劳动合同协议，并且协议内容合法有效，那么双方应按照协议约定履行各自的义务。如果一方违反协议约定，另一方可以通过法律途径来追究其违约责任。
- 如果双方未签订解除劳动合同协议，并且存在争议或纠纷，那么员工可以通过劳动仲裁等法律途径来解决争议。在仲裁过程中，仲裁机构会根据相关法律法规和事实情况来作出裁决。
总结：员工在工作两年未签订劳动合同的情况下离职，是否需要签订解除劳动合同协议取决于双方的具体情况和协商结果。如果双方能够就离职补偿、工作交接等事项达成一致意见，建议签订协议以明确权利义务；如果无法达成一致意见或存在争议，则无需签订协议，并可通过法律途径解决争议。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。