核心前提：公司员工利用公司资金或个人职务便利获取的资金，用于非工作目的（如包养“小三”）的行为，涉及公司财产管理、职务行为规范及可能的法律责任问题。
结论前置：
- 若员工使用公司资金：公司有权要求员工返还资金，并视情节轻重采取纪律处分，甚至追究法律责任。
- 若员工使用个人工资但违反公司规定：公司可依据规章制度进行处分，但需注意处分程序的合法性。
- 若涉及职务侵占或贪污：可能构成刑事犯罪，公司应报警并配合司法机关调查。
详细分析：
员工使用公司资金养“小三”：
- 公司财产权保护：公司资金属于公司所有，员工无权擅自使用于个人目的。公司发现后，应立即要求员工返还资金，并可通过内部财务流程进行核查和追讨。
- 纪律处分：根据公司的规章制度，员工此类行为可能构成严重违反公司纪律，公司有权给予警告、记过、降职、解雇等处分。
- 法律责任：若员工行为涉嫌职务侵占（即利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有，数额较大），公司可向公安机关报案，追究其刑事责任。
员工使用个人工资但违反公司规定或道德准则：
- 公司规章制度：若公司规章制度中明确禁止员工将工资用于不道德或非法目的（尽管此条款可能难以直接执行于个人工资使用），公司可依据规定对员工进行处分。但需注意，处分应基于明确、合理的规章制度，且程序合法。
- 道德引导：公司可通过培训、宣传等方式，引导员工树立正确的价值观，但无法直接干预员工个人工资的具体使用。
涉及职务侵占或贪污的刑事犯罪：
- 刑事责任：若员工利用职务便利，将公司资金非法占为己有，用于包养“小三”等个人目的，且数额较大，可能构成职务侵占罪或贪污罪（如为国家工作人员）。公司应立即向公安机关报案，并配合调查。
- 民事赔偿：除刑事责任外，公司还可通过民事诉讼，要求员工赔偿因职务侵占或贪污给公司造成的损失。
建议与注意事项：
- 公司应建立健全的财务管理制度和内部控制机制，防止员工滥用公司资金。
- 制定明确的规章制度，对员工行为进行规范，并确保处分程序的合法性和公正性。
- 加强员工法律意识和道德教育，提高员工对职务行为规范的认识。
- 发现员工违法行为时，应及时采取措施，包括但不限于要求返还资金、给予纪律处分、报警等。
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