在另一家公司兼职且发放工资是否会被发现，取决于多种因素，无法给出绝对结论，但存在被发现的可能性。以下从不同角度进行分析：
税务与社保角度
税务申报：
- 根据我国税法规定，个人从两处或两处以上取得工资、薪金所得的，应选择并固定向其中一处单位所在地的主管税务机关申报纳税。
- 如果兼职单位未按照规定进行税务申报，或者个人未进行合并申报，税务机关在核查时可能会发现这一情况。
社保缴纳：
- 如果个人在两家单位都同时缴纳社保，这可能导致社保重复缴纳的问题。
- 社保经办机构在审核时，若发现个人存在重复缴纳社保的情况，可能会进行进一步调查，从而发现个人在另一家公司兼职的事实。
合同与劳动关系角度
劳动合同：
- 如果个人与全职单位签订的劳动合同中明确规定了禁止兼职的条款，那么个人在另一家公司兼职就违反了劳动合同的约定。
- 全职单位在发现后，有权依据劳动合同的约定采取相应的措施，包括解除劳动合同等。
劳动关系：
- 兼职单位与个人之间也存在劳动关系，如果兼职单位未按照规定与个人签订书面劳动合同或未缴纳社保等，也可能引发劳动争议。
- 在劳动争议处理过程中，个人在另一家公司兼职的事实可能会被揭露。
法律责任与后果角度
法律责任：
- 如果个人在另一家公司兼职且未进行合法的税务申报和社保缴纳，可能面临税务处罚和社保补缴等法律责任。
- 如果兼职行为违反了与全职单位的劳动合同约定，还可能面临违约责任等。
后果影响：
- 被发现兼职后，个人可能面临全职单位的处罚，包括解除劳动合同、扣发工资等。
- 同时，兼职单位也可能因为个人的兼职行为而受到牵连，如面临劳动争议、税务处罚等。
建议与措施
合法合规：
- 个人在兼职时，应确保与全职单位和兼职单位都签订了合法的劳动合同，并按照规定进行税务申报和社保缴纳。
- 如果全职单位的劳动合同中明确禁止兼职，个人应谨慎考虑是否继续兼职。
沟通协商：
- 如果个人希望继续兼职，可以与全职单位进行沟通协商，看是否可以调整劳动合同中的相关条款。
- 同时，也可以与兼职单位协商，确保兼职行为不会违反任何法律法规和劳动合同的约定。
总结来看，在另一家公司兼职且发放工资是否会被发现，取决于税务申报、社保缴纳、劳动合同以及劳动关系等多个方面。为了避免不必要的法律风险和后果，个人在兼职时应确保合法合规，并与相关单位进行充分的沟通协商。如果有任何法律问题或疑虑，可以直接向我咨询。