核心结论：劳动合同中约定乙方无故辞职扣50%报酬的条款，一般属于无效条款，用人单位不得以此为由克扣劳动者报酬。以下从法律角度详细分析：

1. 该条款违反法律强制性规定

根据《劳动合同法》第三十条、第三十八条及《工资支付暂行规定》第九条：

• 工资必须全额支付：用人单位应当按照劳动合同约定和国家规定，向劳动者及时足额支付劳动报酬，不得克扣或无故拖欠。
• 辞职权是劳动者法定权利：劳动者提前30日（试用期3日）书面通知用人单位即可解除劳动合同，无需用人单位同意。即使劳动者未提前通知（即“无故辞职”），用人单位也仅能通过要求赔偿实际损失（如有）来维权，无权直接扣减工资。
• 扣减工资的合法情形：仅在劳动者因本人原因给用人单位造成经济损失时，用人单位可按劳动合同约定要求赔偿，但每月扣减部分不得超过劳动者当月工资的20%，且扣减后剩余工资不得低于当地最低工资标准。“无故辞职扣50%工资”远超法定比例，属于违法。

2. 用人单位可能面临的法律后果

• 补发工资+赔偿：劳动者可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求用人单位补发被扣工资，并可能获得50%-100%的赔偿金（依据《劳动合同法》第八十五条）。
• 行政处罚：劳动行政部门可责令用人单位限期支付劳动报酬，逾期不支付的，责令加付赔偿金，并可能对用人单位处以罚款。

3. 对劳动者的建议

• 保留证据：保存劳动合同、工资条、扣款通知等证据。
• 协商或投诉：先与用人单位协商，协商不成可向当地劳动监察大队投诉或申请劳动仲裁。
• 注意时效：劳动争议申请仲裁的时效为1年，自知道或应当知道权利被侵害之日起计算。

4. 对用人单位的建议

• 修改合同条款：删除违法扣款条款，改为合法赔偿约定（如明确劳动者未提前通知导致损失的赔偿范围）。
• 完善制度：通过规章制度（需经民主程序公示）规定劳动者未履行通知义务的赔偿责任，但赔偿金额需合理且符合法律规定。

总结：劳动合同中“无故辞职扣50%报酬”的条款因违法而无效，用人单位不得以此克扣工资。若您遇到此类情况，可直接向我咨询具体维权步骤。