合同内辞职扣当月百分之五十的工资，在大多数情况下是不合法的。以下从不同角度对此问题进行分析：

一、常规情况下的合法性分析

根据《中华人民共和国劳动法》第五十条及《工资支付暂行规定》第九条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。劳动关系双方依法解除或终止劳动合同时，用人单位应在解除或终止劳动合同时一次付清劳动者工资。因此，用人单位在员工辞职时无故扣除50%工资的行为，违反了上述法律规定，属于克扣工资的违法行为。

二、特殊情况下的合法性分析

尽管常规情况下扣除50%工资是不合法的，但也存在特殊情况。如果员工辞职未按照劳动合同或法律规定提前通知用人单位，且因此给用人单位造成了实际经济损失，用人单位有权要求员工赔偿经济损失。然而，在此情况下，赔偿金额的扣除也需遵循一定的限制：

1. 扣除额度限制：每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则应按最低工资标准支付。
2. 一次性付清：即便存在经济损失赔偿，用人单位也应在员工辞职时一次性付清剩余的工资。
3. 合法性与合理性：扣除工资的行为必须基于合法的劳动合同约定，并且损失确实是由员工未提前通知辞职所导致的。

三、员工应对措施

面对辞职时被扣除50%工资的情况，员工应采取以下措施维护自己的合法权益：

1. 了解原因：首先弄清楚工资被扣除的具体原因，是否属于合法扣除范畴。
2. 协商解决：与用人单位进行沟通协商，要求其提供扣除工资的合理解释和依据，并要求足额支付工资。
3. 法律途径：若协商无果，员工可以向当地劳动监察部门投诉，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。在必要时，还可以选择通过诉讼途径来维护自己的权益。

总结与建议：

合同内辞职扣当月百分之五十的工资，在大多数情况下是不合法的。员工在面对此类情况时，应了解自己的合法权益，并采取适当的措施进行维权。如果员工对法律程序不熟悉或担心自己无法有效维权，可以直接向我咨询，我将根据具体情况提供专业的法律建议和帮助。