司机在运输上货过程中从车上掉下来意外受重伤，托运厂方是否有责任，以及农合是否还能赔偿，需要分情况讨论：

托运厂方责任分析

1. 若存在雇佣或劳务关系：

   • 如果司机与托运厂方之间存在雇佣关系或劳务关系，根据《中华人民共和国民法典》中关于雇主责任的规定，雇主（即托运厂方）应当对雇员（即司机）在从事雇佣活动中遭受的人身损害承担赔偿责任。这包括司机在上货过程中从车上掉下来受伤的情况。
   • 赔偿范围：通常包括医疗费、误工费、护理费、交通费、住宿费、住院伙食补助费、必要的营养费等。如果造成残疾，还包括残疾赔偿金、残疾辅助器具费等；如果造成死亡，还包括丧葬费、被扶养人生活费、死亡补偿费等。

2. 若不存在雇佣或劳务关系：

   • 如果司机与托运厂方之间不存在雇佣关系或劳务关系，而是独立的运输合同关系或其他关系，那么托运厂方的责任将取决于具体的合同条款和法律规定。
   • 一般原则：除非托运厂方存在过错（如未提供安全的工作环境、未履行安全保障义务等），否则通常不承担赔偿责任。

农合赔偿分析

1. 农合的基本性质：

   • 农合（新型农村合作医疗）是一种社会保险制度，旨在为农村居民提供基本的医疗保障。

2. 农合的赔偿范围：

   • 农合通常覆盖因疾病或意外伤害导致的医疗费用。因此，如果司机因从车上掉下来受伤而产生了医疗费用，且这些费用符合农合的报销范围，那么司机有权向农合申请报销。

3. 农合与第三方赔偿的关系：

   • 农合的报销并不受第三方是否赔偿的影响。即使司机从托运厂方或其他责任方获得了赔偿，仍然可以申请农合的报销。但需要注意的是，农合报销时可能会要求提供相关的医疗费用发票和诊断证明等文件，且报销金额可能受到农合政策规定的限制。

综合建议

1. 收集证据：

   • 司机应尽快收集与受伤相关的证据，包括医疗费用发票、诊断证明、事故现场照片或视频等。

2. 与托运厂方协商：

   • 如果认为托运厂方存在责任，可以尝试与托运厂方进行协商，看是否能够达成赔偿协议。

3. 申请农合报销：

   • 同时，司机应尽快向当地的农合管理机构申请报销医疗费用。

4. 寻求法律帮助：

   • 如果协商无果或农合报销遇到问题，司机可以寻求专业的法律帮助，比如直接向我咨询，以维护自己的合法权益。

总结：司机在运输上货过程中从车上掉下来意外受重伤，托运厂方是否有责任取决于双方之间的法律关系和具体事实。同时，司机仍然有权向农合申请报销医疗费用。在处理此类问题时，建议司机收集相关证据、与托运厂方协商、申请农合报销，并在必要时寻求法律帮助。