在政府部门当科长，请假是否会扣工资，这主要取决于请假类型、单位规定以及相关法律法规。以下是对此问题的详细分析：
一、请假类型与工资扣除
事假：
- 事假通常是因为个人原因需要请假，如处理私人事务等。
- 根据一般的劳动法规和单位规定，事假期间单位可以不支付工资。但具体是否扣工资，还需看单位的具体规章制度。有些单位可能会按照一定比例扣除工资，有些则可能不扣。
病假：
- 病假是因为员工生病或受伤需要请假治疗。
- 根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》等相关法规，员工在医疗期内享有病假工资或疾病救济费。这些费用通常不低于当地最低工资标准的80%。对于政府部门而言，虽然具体规定可能有所不同，但一般也会保障员工在病假期间的合理收入。
年假、婚假、产假等法定假期：
- 这些假期是员工依法享有的休息时间，单位应当支付全额工资。
- 政府部门作为国家机关，通常会严格遵守相关法律法规，保障员工在法定假期期间的工资待遇。
二、单位规定与工资扣除
- 除了法律法规外，单位的具体规章制度也会对请假期间的工资扣除产生影响。
- 政府部门通常会有完善的内部管理制度，包括请假制度、工资制度等。因此，科长请假是否会扣工资，还需参考所在单位的具体规定。
三、法律建议与注意事项
了解单位规定：
- 在请假前，科长应详细了解所在单位的请假制度和工资制度，明确请假期间的工资待遇。
遵守法律法规：
- 无论是单位规定还是法律法规，都应得到严格遵守。科长在请假时，应确保自己的行为符合相关规定。
与单位沟通：
- 如果对请假期间的工资待遇有疑问或不满，科长可以与单位的人力资源部门或相关负责人进行沟通，寻求解决方案。
总结来看，在政府部门当科长，请假是否会扣工资并没有一个固定的答案。它取决于请假类型、单位规定以及相关法律法规。因此，科长在请假前应详细了解相关规定，确保自己的权益得到保障。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。