初步设计费和施工图设计费合计100万，分开后不进行招标，这一行为是否合法合规，需结合具体情况及相关法律法规进行综合分析，不能一概而论。以下从不同角度进行详细阐述：

1. 招标法律法规的适用性

• 必须招标的范围：根据《中华人民共和国招标投标法》及相关规定，对于大型基础设施、公用事业等关系社会公共利益、公众安全的项目，以及全部或者部分使用国有资金投资或者国家融资的项目，其勘察、设计、施工、监理以及与工程建设有关的重要设备、材料等的采购，必须进行招标。若您的项目属于此类必须招标的范围，那么将初步设计费和施工图设计费分开并不进行招标，显然是不合法合规的。
• 非必须招标的情况：如果项目不属于必须招标的范围，或者虽然属于必须招标范围但符合某些特定条件（如项目性质特殊、涉及国家安全或秘密等），可以依法不进行招标。但这种情况较为特殊，且需有明确的法律依据或政府批准。

2. 分开设计费的合法性

• 合同自由原则：在符合法律法规的前提下，合同双方有权自由约定设计费的支付方式和金额。因此，将初步设计费和施工图设计费分开约定，本身并不违反法律规定。
• 避免规避招标：然而，如果分开设计费的目的是为了规避必须招标的法律规定，即通过拆分合同金额来逃避招标程序，那么这种行为就是不合法的。

3. 合规性建议

• 审查项目性质：首先，应审查项目是否属于必须招标的范围。如果是，则必须按照法律规定进行招标。
• 咨询专业意见：在不确定项目是否需要招标时，建议咨询专业的法律人士或招标代理机构，以确保合规性。
• 完善合同条款：如果项目不需要招标，或者符合不招标的条件，那么在签订设计合同时，应明确约定设计费的支付方式、金额及时间等条款，以避免后续纠纷。

4. 可能的法律后果

• 行政处罚：如果违反招标投标法的规定，不进行招标或规避招标，可能会面临行政处罚，包括罚款、责令改正等。
• 合同无效：如果通过拆分合同金额来规避招标，且该行为被认定为违法，那么相关合同条款可能会被认定为无效，导致合同双方的权利义务关系发生变化。

针对您的情况，我建议您：

• 首先确认项目是否属于必须招标的范围；
• 如果属于必须招标范围，则必须按照法律规定进行招标；
• 如果不属于必须招标范围或符合不招标的条件，那么在签订设计合同时应确保合同条款的合法性和合规性；
• 在整个过程中，如有任何疑问或不确定之处，应及时咨询专业的法律人士以获取准确和全面的法律意见。

如有任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。