自己在家写的房屋过户协议，若父亲替母亲签字而母亲仅按手印，该协议的效力需根据具体情况来判断，不能直接认定有效或无效。以下是从不同角度进行的分析：

一、协议效力的基本判断原则

1. 真实意思表示：

   • 房屋过户协议作为民事法律行为，其有效性首先取决于双方是否真实表达了过户的意愿。若母亲确实同意过户，并亲自按手印确认，这可以视为其真实意思表示的一种形式。

2. 签字与按手印的法律效力：

   • 签字是确认合同内容、表达同意的一种常见方式。然而，在母亲无法签字或选择不签字的情况下，按手印也可以作为一种确认方式，尤其是在母亲具备完全民事行为能力且按手印行为系其真实意愿的情况下。
   • 但若父亲未经母亲授权或母亲明确表示反对，父亲代为签字则可能构成无权代理，影响协议的效力。

二、可能影响协议效力的因素

1. 母亲的民事行为能力：

   • 若母亲具备完全民事行为能力，且按手印行为系其真实意愿，则协议可能有效。
   • 若母亲为限制民事行为能力人或无民事行为能力人，则其按手印行为可能需经法定代理人同意或追认，否则协议可能无效。

2. 父亲的代理权限：

   • 若父亲获得母亲的明确授权（如书面授权书）代为签字，则协议可能有效。
   • 若父亲未经授权代为签字，且母亲事后未追认，则协议可能因无权代理而无效。

3. 协议内容的合法性与合规性：

   • 协议内容需符合法律法规的规定，如过户程序、税费缴纳等。若协议内容违法或违规，则可能影响其效力。

三、建议与措施

1. 确认母亲的意愿：

   • 与母亲进行沟通，确认其是否确实同意过户，并了解其按手印的具体意图。

2. 补全授权手续：

   • 若父亲代为签字，建议尽快补全母亲的授权手续，如签署书面授权书等。

3. 咨询专业律师：

   • 由于房屋过户涉及重大财产权益，建议咨询专业律师以获取更具体的法律意见。律师可以根据具体情况分析协议的效力，并提供相应的法律建议。

4. 考虑重新签署协议：

   • 若存在疑虑或争议，可以考虑重新签署一份由母亲亲自签字的房屋过户协议，以确保其法律效力。

如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。我会根据你的具体情况提供更详细的法律意见。