针对您提出的“员工罚款从工资里扣补偿公司损失怎么算”的问题，以下是我为您提供的详细解答：
首先，需要明确的是，员工因故意或重大过失给公司造成经济损失时，公司确实有权要求员工进行赔偿。这种赔偿通常可以通过从员工工资中扣除一定金额的方式来实现，但这一过程必须遵循严格的法律规定和操作流程。
一、扣除比例与最低工资标准
扣除比例：根据相关法律法规，公司从员工工资中扣除罚款以补偿损失时，每月扣除的部分不得超过员工当月工资的20%。这一比例限制旨在保护员工的合法权益，防止公司过度扣除工资导致员工生活困难。
最低工资标准：扣除罚款后，员工的剩余工资不得低于当地月最低工资标准。这是为了确保员工的基本生活需求得到满足，避免因罚款而导致员工陷入经济困境。
二、公司规章制度与公示
公司应明确规章制度，在员工手册等文件中详细规定赔偿情形、方式、计算方法等。这些规定必须经民主程序制定，并确保已向员工公示。这样，在发生经济损失时，公司可以依据这些规定来合理计算和扣除员工的罚款。
三、具体计算方法与示例
以员工违规操作致设备损坏为例，假设维修费用为5000元，员工当月工资为8000元。根据规定，公司每月最多可以扣除员工工资的20%，即1600元。如果维修费用需要分几个月扣除，那么公司应确保每月扣除的金额不超过1600元，并且扣除后员工的剩余工资不低于当地月最低工资标准。
四、员工异议与劳动争议解决
如果员工对罚款有异议，公司应提供充分证据证明损失的存在、员工过错程度等。如果协商不成，可能引发劳动争议。在这种情况下，员工可以通过合法途径解决争议，如向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁等。
五、公司罚款的合法性
需要强调的是，公司作为企业并非行政机关，不具备行政处罚的主体资格。因此，公司一般情况下没有权力随意对员工进行罚款。但是，如果员工的行为给公司造成了经济损失，公司可以依据劳动合同约定或规章制度要求员工赔偿。这种赔偿必须合理合法，并且遵循上述的扣除比例和最低工资标准等规定。
综上所述，员工罚款从工资里扣补偿公司损失的计算方法必须遵循严格的法律规定和操作流程。公司应明确规章制度并确保已向员工公示，同时遵循扣除比例和最低工资标准等规定。如果员工对罚款有异议或发生劳动争议，应通过合法途径解决。