针对员工请病假时间很长的情况，办理流程主要涉及病假时长的法律界定、医疗期的确定、以及企业内部的请假流程。以下是一个清晰、详细、有深度的解答：

一、病假时长的法律界定

首先，需要明确的是，病假时长的法律界定主要依据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》。根据该规定，医疗期是企业职工因患病或非因工负伤停止工作治病休息不得解除劳动合同的时限，其长短与职工的工龄直接挂钩。

• 实际工作年限十年以下的：

  • 在本单位工作年限五年以下的，医疗期为三个月；
  • 五年以上的，医疗期为六个月。

• 实际工作年限十年以上的：

  • 在本单位工作年限五年以下的，医疗期为六个月；
  • 五年以上十年以下的，医疗期为九个月；
  • 十年以上十五年以下的，医疗期为十二个月；
  • 十五年以上二十年以下的，医疗期为十八个月；
  • 二十年以上的，医疗期为二十四个月。

特殊疾病：对于某些特殊疾病，医疗期可能会适当延长，但具体延长时长需根据相关法律法规和地方政策确定。

二、医疗期的确定与申请

1. 确定医疗期：员工应根据自己的实际工作年限和在本单位的工作年限，对照上述规定确定自己的医疗期。

2. 申请医疗期：员工在需要停止工作医疗时，应向企业提交正规医疗证明，并按照企业内部的请假流程申请医疗期。申请时，应明确说明自己的病情、预计医疗期时长等信息。

三、企业内部的请假流程

1. 提交申请：员工应按照企业规定的请假流程，向直属上级或人力资源部门提交病假申请，并附上正规医疗证明。

2. 审批流程：企业应根据内部规定，对员工的病假申请进行审批。审批过程中，企业可能会要求员工提供更多关于病情和医疗期的信息。

3. 备案与通知：审批通过后，企业应将员工的病假情况备案，并通知员工本人及其直属上级。同时，企业应确保员工在医疗期内的工资和社保待遇得到保障。

四、注意事项与建议

1. 保留证据：员工在申请病假和医疗期时，应保留好所有相关证据，如医疗证明、请假申请、审批记录等，以备不时之需。

2. 提前沟通：员工在预计需要长时间病假时，应提前与企业沟通，说明自己的病情和预计医疗期时长，以便企业做好相应安排。

3. 遵守规定：员工在医疗期内应遵守企业的相关规定和制度，如按时提交医疗证明、配合企业进行病情复查等。

4. 维权途径：如果员工在医疗期内的权益受到损害，如工资被拖欠、社保被停缴等，可以通过劳动仲裁等途径维权。

综上所述，员工请病假时间很长时，应首先确定自己的医疗期时长，并按照企业内部的请假流程申请医疗期。同时，员工应保留好所有相关证据，提前与企业沟通，并遵守企业的相关规定和制度。如果权益受到损害，可以通过劳动仲裁等途径维权。