公司员工收了客户款项后跑路，客户追究责任时，公司通常是需要承担责任的。以下从不同角度为您详细分析：
一、表见代理情况下的责任承担
若员工收款的行为构成表见代理，即客户有理由相信该员工有代表公司收款的权限，那么公司不能以员工个人行为为由对抗客户。根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，企业法人对其工作人员的经营活动承担民事责任。因此，在这种情况下，公司需要承担售后责任。
法律背景：表见代理是指虽然行为人事实上无代理权，但相对人有理由认为行为人有代理权而与其进行法律行为，其行为的法律后果由被代理人承担的代理。在员工收款跑路的案例中，如果客户能够证明其有理由相信员工有收款权限，那么公司就需要承担相应的责任。
建议：公司应加强对员工的授权管理，明确员工的收款权限，并在与客户交易时，通过书面合同或其他方式明确收款方式和责任主体，以避免表见代理的发生。
二、员工个人行为情况下的责任承担
如果员工纯粹是个人私自收款且未获公司授权，这属于员工的不当行为。在这种情况下，客户可以要求员工返还钱款。若员工拒绝返还，客户可以通过民事诉讼等途径解决。同时，公司发现后应及时采取措施，比如固定证据，若员工行为给公司造成损失，公司可依据内部规定及劳动合同追究员工责任，要求其赔偿损失。
法律背景：根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，劳动者违反劳动合同约定或者公司规章制度，给公司造成损失的，应当承担赔偿责任。因此，在员工个人私自收款的情况下，公司有权向员工追偿。
建议：公司应建立完善的内部监督机制，加强对员工行为的监管，及时发现并制止员工的不当行为。同时，公司应与客户保持密切沟通，及时了解交易情况，以便在发现问题时能够迅速采取措施。
三、公司承担责任后的追偿权
无论在哪种情况下，公司承担责任后都有权向员工进行追偿。因为员工的行为属于严重违反劳动纪律和损害公司利益，公司可依据内部规章制度和法律规定，要求员工赔偿因其行为给公司造成的损失。
法律背景：根据《中华人民共和国民法典》和《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，公司承担民事责任后，有权向有过错的员工追偿。这是公司维护自身合法权益的重要手段。
建议：公司在承担责任后，应及时收集证据，证明员工的过错行为以及给公司造成的损失。然后，公司可以通过内部调解、仲裁或诉讼等途径向员工追偿。
四、涉嫌犯罪情况下的处理
如果员工的行为涉嫌犯罪，如诈骗、职务侵占等，公司还应及时向公安机关报案，追究其刑事责任。这不仅可以维护公司的合法权益，还可以对其他员工起到警示作用。
法律背景：根据《中华人民共和国刑法》的相关规定，诈骗、职务侵占等行为均构成犯罪，应依法追究刑事责任。因此，在员工行为涉嫌犯罪的情况下，公司有权向公安机关报案。
建议：公司在发现员工行为涉嫌犯罪后，应及时收集证据，并向公安机关报案。同时，公司应配合公安机关的调查工作，提供必要的协助和支持。
总结与后续建议：
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