政府采购项目中留有10%的款项在质保期满后再付，这一做法本身并不直接违反法律法规。不过，是否合规还需结合具体合同条款、采购方式以及相关法律法规进行综合分析。以下从不同角度进行详细说明：

1. 合同自由原则

• 在政府采购中，合同双方（采购人与供应商）有权在遵守法律法规的前提下，自由约定合同条款，包括付款方式和时间。因此，如果合同中明确约定了质保期满后支付剩余款项，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么这种做法是合法的。

2. 政府采购法规的考量

• 政府采购活动需遵循《中华人民共和国政府采购法》及其相关实施条例。这些法规主要规范了政府采购的程序、方式、合同签订及履行等方面。虽然它们没有直接规定付款时间，但要求政府采购活动应当遵循公开透明、公平竞争、公正和诚实信用的原则。
• 如果质保期满后付款的约定符合这些原则，且没有损害国家利益、社会公共利益或他人合法权益，那么这种做法是合规的。

3. 质保金与付款条款的合理性

• 在实践中，政府采购合同中常设置质保金条款，以确保供应商在质保期内履行质量保证责任。质保金的比例和支付时间通常由合同双方协商确定。
• 留有10%的款项在质保期满后再付，可以视为一种质保金安排。只要这种安排是合理的，且符合合同双方的利益平衡，那么它就是合法的。

4. 潜在风险与合规建议

• 风险点：如果质保期过长或质保金比例过高，可能会给供应商带来资金压力，甚至影响其正常经营。同时，如果采购人无正当理由拖延支付剩余款项，也可能构成违约。
• 合规建议：
  • 合同双方应在签订合同时明确约定质保期、质保金比例及支付时间等条款，确保条款清晰、合理。
  • 采购人应严格按照合同约定履行付款义务，避免无正当理由拖延支付。
  • 供应商应关注合同条款的履行情况，及时维护自身合法权益。

5. 特殊情况下的合规性

• 如果政府采购项目涉及特定领域或特殊要求（如国防、安全等），可能存在额外的法规或政策限制。在这种情况下，付款方式的约定需符合相关法规或政策的要求。

总结与建议：政府采购项目中留有10%的款项在质保期满后再付，这一做法本身并不直接违反法律法规。但为确保合规性，合同双方应在签订合同时充分考虑各种因素，明确约定合同条款，并严格按照合同约定履行各自义务。如果有任何疑问或需要进一步的法律建议，可以直接向我咨询。