政府采购合同中约定质保期满后支付尾款，这一做法本身并不违法。以下从多个角度进行详细分析：
法律合规性角度
合同自由原则：根据《中华人民共和国民法典》的相关规定，合同双方当事人在平等、自愿、公平、诚实信用的基础上，有权自由约定合同的内容，包括付款方式、付款时间等。因此，政府采购合同中约定质保期满后支付尾款，是合同双方协商一致的结果，符合合同自由原则。
政府采购法规定：虽然《中华人民共和国政府采购法》及其实施条例对政府采购合同的签订、履行等进行了规范，但并未明确禁止在合同中约定质保期满后支付尾款。只要该约定不违反法律法规的强制性规定，不损害国家利益、社会公共利益和他人合法权益，就是合法有效的。
实际操作角度
保障质量：约定质保期满后支付尾款，可以在一定程度上保障供应商提供的产品或服务的质量。因为如果产品或服务在质保期内出现问题，采购方有权要求供应商进行维修、更换或退货等处理，而尾款支付则作为对供应商履行质保义务的一种约束。
风险控制：对于采购方而言，约定质保期满后支付尾款也是一种风险控制手段。它可以在一定程度上降低因供应商违约或产品或服务质量问题而给采购方带来的损失风险。
注意事项
明确约定：在政府采购合同中，应明确约定质保期的期限、尾款支付的条件和时间等关键条款，以避免因约定不明而产生的纠纷。
合法合规：虽然约定质保期满后支付尾款本身不违法，但合同双方应确保该约定不违反其他法律法规的强制性规定，如税收法规、财务法规等。
公平合理：合同双方在约定质保期和尾款支付条款时，应遵循公平、合理的原则，确保条款内容对双方都是公平合理的，避免出现显失公平的情况。
总结与建议：政府采购合同中约定质保期满后支付尾款是合法且可行的做法。在实际操作中，合同双方应明确约定相关条款，确保合法合规且公平合理。如果您在政府采购合同签订或履行过程中遇到任何法律问题或纠纷，可以直接向我咨询，我会根据您的具体情况提供专业的法律意见和解决方案。