政府采购合同可以约定尾款在免费运维期满支付，但需满足以下条件并注意相关事项：

1. 符合法律法规要求
   根据《中华人民共和国政府采购法》及其实施条例，政府采购合同应当遵循公平、公正、诚实信用原则。只要合同条款不违反法律强制性规定（如不得设置不合理条件排斥供应商、不得损害国家利益和社会公共利益等），双方可协商约定尾款支付条件。将尾款与免费运维期挂钩，本质上是将付款与供应商履约质量关联，属于合法商业安排。

2. 合同条款需明确具体
   合同中应清晰约定以下内容：

   • 免费运维期的期限（如1年、2年）；
     
   • 运维服务范围（如系统维护、故障排除、技术支持等）；
     
   • 尾款支付条件（如运维期满后经验收合格支付，或自动支付）；
     
   • 违约责任（如供应商未履行运维义务，采购人有权扣减尾款或要求赔偿）。
     避免因条款模糊引发争议。

3. 需符合财政资金支付规定
   政府采购资金通常纳入预算管理，合同支付条款需与财政部门审批的预算一致。若合同约定尾款在运维期满后支付，需确保该安排符合财政资金支付流程（如分期支付、预留质保金等规定），避免因财政审批问题导致支付延迟。

4. 建议增加验收环节
   为保障采购人权益，可在运维期满后设置验收程序，由采购人或第三方机构对运维服务进行评估。验收合格后支付尾款，既能督促供应商履行义务，也能为付款提供合理依据。

风险提示：
若合同未明确运维标准或验收流程，供应商可能以“已履行运维义务”为由要求支付尾款，而采购人可能因无法证明供应商违约而陷入被动。因此，建议通过书面形式固定双方权利义务，必要时可咨询专业律师审核合同条款。

如有进一步疑问，可直接向我咨询政府采购合同相关法律问题。