公司能否收取员工违约金，需根据具体情况及协议内容来判断。在符合法定情形下，如服务期约定或竞业限制约定，且协议中明确规定了违约金条款，公司可以依法收取违约金；否则，公司不得随意收取员工违约金。以下是对这一问题的详细分析：

一、一般情况下不能收取违约金

根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位通常不得与劳动者约定由劳动者承担违约金。这是为了保障劳动者的合法权益，防止用人单位滥用违约金条款给劳动者造成不必要的负担。在大多数情况下，如果劳动合同或公司规章制度中没有明确约定违约金条款，公司是无权要求员工支付违约金的。

二、特殊情形下可以收取违约金

尽管一般情况下公司不能收取违约金，但在某些特殊情形下，公司是可以依法收取违约金的。这些特殊情形主要包括：

1. 服务期约定：

   • 当用人单位为劳动者提供了专项培训费用，并进行了专业技术培训时，双方可以订立协议，约定服务期。
   • 若劳动者违反服务期约定提前离职，应按照协议约定向用人单位支付违约金。违约金的数额有严格限制，不得超过用人单位提供的培训费用，并且应按服务期尚未履行部分所应分摊的培训费用来计算。
   • 举例：若公司花费5万元送员工参加专业培训，并约定5年服务期，员工工作2年后离职，则公司最多可要求员工支付3万元的违约金（即5万元培训费用按5年分摊，每年1万元，员工已工作2年，剩余3年未履行，故支付3万元违约金）。

2. 竞业限制约定：

   • 用人单位与劳动者可以在劳动合同或保密协议中约定竞业限制条款，以保护用人单位的商业秘密和知识产权。
   • 对负有保密义务的劳动者（如高级管理人员、高级技术人员等），用人单位可以在解除或终止劳动合同后，在竞业限制期限内按月给予经济补偿。
   • 若劳动者违反竞业限制约定，应按照协议约定向用人单位支付违约金。竞业限制期限不得超过二年。

三、法律条件与协议内容的双重约束

公司收取员工违约金必须同时满足法律规定的条件和协议中的明确约定。如果未签订服务期协议或竞业限制协议，或协议中未明确规定违约金条款，则公司不得随意收取员工违约金。此外，即使协议中有违约金条款，但如果条款内容违反了法律法规的强制性规定，也是无效的。

四、劳动者的权益保护

劳动者在面对不合法或不合理的违约金要求时，有权通过合法途径维护自身权益。例如，可以向劳动争议调解委员会申请调解，或者向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。如果对仲裁结果不服，还可以向人民法院提起诉讼。

总结来看，公司在收取员工违约金时必须严格遵守法律规定和协议约定，确保行为的合法性和合理性。同时，劳动者也应了解自身权益，避免在不必要的情况下承担不合理的违约责任。如果您在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。